RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394272.7

HDDC3-202, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HDDC3, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-202ENST00000394272 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 EHBP1Q8NDI1 1231 aa22.03■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 COQ4Q9Y3A0 265 aa22.03■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 TRIM17Q9Y577 477 aa22.03■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa22.03■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 ANK1P16157 1881 aa22.03■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 TSPAN1O60635 241 aa22.03■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 TNFSF9P41273 254 aa22.03■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 SEZ6Q53EL9 994 aa22.03■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 TAF2Q6P1X5 1199 aa22.03■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa22.03■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 SESTD1Q86VW0 696 aa22.03■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 CDT1Q9H211 546 aa22.03■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 CDHR5Q9HBB8 845 aa22.03■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 CLCN1P35523 988 aa22.02■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa22.02■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 SV2AQ7L0J3 742 aa22.02■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 RNF180Q86T96 592 aa22.02■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 NME8Q8N427 588 aa22.02■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 PDZD7Q9H5P4 517 aa22.02■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 PDE11AQ9HCR9 933 aa22.02■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 TMEM132AQ24JP5 1023 aa22.01■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 LHX8Q68G74 356 aa22.01■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF710Q8N1W2 664 aa22.01■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF516Q92618 1163 aa22.01■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 FNBP1Q96RU3 617 aa22.01■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 OSMRQ99650 979 aa22.01■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 BEGAINQ9BUH8 593 aa22.01■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 APEX2Q9UBZ4 518 aa22.01■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 MYO6Q9UM54 1294 aa22.01■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 GINS2Q9Y248 185 aa22.01■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa22.01■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 GRIN2DO15399 1336 aa22.01■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 A0A1B0GUA9 196 aa22■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 ERLIN2O94905 339 aa22■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 DARSP14868 501 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 JAM2P57087 298 aa22■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP22■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 IQCEQ6IPM2 695 aa22■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 GJB7Q6PEY0 223 aa22■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 CPB2Q96IY4 423 aa22■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 CEP350Q5VT06 3117 aa22■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 PTPRJQ12913 1337 aa22■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 LRRN2O75325 713 aa22■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 MCF2P10911 925 aa22■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 HSPA6P17066 643 aa22■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 CEP120Q8N960 986 aa22■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 CGRRF1Q99675 332 aa22■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 AIPL1Q9NZN9 384 aa22■■□□□ 1.11
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HDDC3-202ENST00000394272 RFX1P22670 979 aa21.99■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 SFMBT2Q5VUG0 894 aa21.99■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa21.99■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 TAS1R2Q8TE23 839 aa21.99■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 SEMA4DQ92854 862 aa21.99■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa21.99■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa21.99■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 TNNI1P19237 187 aa21.98■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 SNX17Q15036 470 aa21.98■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 ZACNQ401N2 412 aa21.98■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 HGSNATQ68CP4 663 aa21.98■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 THNSL1Q8IYQ7 743 aa21.98■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 FBXL13Q8NEE6 735 aa21.98■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 TMEM40Q8WWA1 233 aa21.98■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa21.98■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 DESI2Q9BSY9 194 aa21.98■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 ADGRG1Q9Y653 693 aa21.98■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 CABYRO75952 493 aa21.98■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 ACLYP53396 1101 aa21.98■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 RAPGEF1Q13905 1077 aa21.98■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 FAM47CQ5HY64 1035 aa21.98■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 SERINC5Q86VE9 423 aa21.98■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 CCDC170Q8IYT3 715 aa21.98■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 FAM84AQ96KN4 292 aa21.98■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 SPAG5Q96R06 1193 aa21.98■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 STK33Q9BYT3 514 aa21.98■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 RAB20Q9NX57 234 aa21.98■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 WBP1LQ9NX94 342 aa21.98■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 DNAJC12Q9UKB3 198 aa21.98■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 MOXD2PA6NHM9 499 aa21.97■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 CCP110O43303 1012 aa21.97■■□□□ 1.11
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