RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392449.4

PTPRK-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 1,456 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-208ENST00000392449 MAPK6Q16659 721 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 PALB2Q86YC2 1186 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 SNX29Q8TEQ0 813 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 PHOX2BQ99453 314 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 C2orf40Q9H1Z8 148 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 CHST7Q9NS84 486 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 ADAM28Q9UKQ2 775 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 SORCS3Q9UPU3 1222 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 E9PMD0 336 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 N4BP3O15049 544 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 NR1I2O75469 434 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 ADH1AP07327 375 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 MTMR3Q13615 1198 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 IGSF22Q8N9C0 903 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 RXFP1Q9HBX9 757 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 GDAQ9Y2T3 454 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 TRIP11Q15643 1979 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 ACKR2O00590 384 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 KIF4AO95239 1232 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 GLUD1P00367 558 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 RTP2Q5QGT7 225 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 NT5DC1Q5TFE4 455 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 CCDC149Q6ZUS6 474 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 KCNK18Q7Z418 384 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 PIEZO1Q92508 2521 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 TADA2AO75478 443 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 TUSC3Q13454 348 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 NAB2Q15742 525 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 GLRA4Q5JXX5 417 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 MCTP1Q6DN14 999 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 DAW1Q8N136 415 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 RUSC1Q9BVN2 902 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 KCNH6Q9H252 994 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 USTQ9Y2C2 406 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 VWA8A3KMH1 1905 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 TGM5O43548 720 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 MUTP22033 750 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 MRE11P49959 708 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 TCF15Q12870 199 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 PDIA5Q14554 519 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 PPP2R5AQ15172 486 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 RABEP1Q15276 862 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 USP41Q3LFD5 358 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 CEP120Q8N960 986 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 IFT74Q96LB3 600 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 ADPGKQ9BRR6 497 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
PTPRK-208ENST00000392449 CCDC169A6NNP5 214 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRK-208ENST00000392449 HIP1RO75146 1068 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRK-208ENST00000392449 THP07101 528 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRK-208ENST00000392449 AVPR2P30518 371 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRK-208ENST00000392449 PEX3P56589 373 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRK-208ENST00000392449 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
PTPRK-208ENST00000392449 ATF7IP2Q5U623 682 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRK-208ENST00000392449 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRK-208ENST00000392449 CEP57Q86XR8 500 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRK-208ENST00000392449 UBALD2Q8IYN6 164 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRK-208ENST00000392449 KIFAP3Q92845 792 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRK-208ENST00000392449 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
PTPRK-208ENST00000392449 TMX3Q96JJ7 454 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRK-208ENST00000392449 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP18.26■□□□□ 0.51
PTPRK-208ENST00000392449 NPTX2P47972 431 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRK-208ENST00000392449 FAM171A1Q5VUB5 890 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRK-208ENST00000392449 TAS1R3Q7RTX0 852 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRK-208ENST00000392449 PLCD3Q8N3E9 789 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRK-208ENST00000392449 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
PTPRK-208ENST00000392449 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
PTPRK-208ENST00000392449 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
PTPRK-208ENST00000392449 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
PTPRK-208ENST00000392449 PLIN2Q99541 437 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRK-208ENST00000392449 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRK-208ENST00000392449 FAM86C1Q9NVL1 165 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRK-208ENST00000392449 DOCK6Q96HP0 2047 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRK-208ENST00000392449 SFI1A8K8P3 1242 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRK-208ENST00000392449 ADAM12O43184 909 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRK-208ENST00000392449 EFNA5P52803 228 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRK-208ENST00000392449 OSTNP61366 133 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRK-208ENST00000392449 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRK-208ENST00000392449 MAPK7Q13164 816 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRK-208ENST00000392449 KRT79Q5XKE5 535 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRK-208ENST00000392449 DTHD1Q6ZMT9 781 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRK-208ENST00000392449 OTOP3Q7RTS5 596 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRK-208ENST00000392449 RSAD2Q8WXG1 361 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRK-208ENST00000392449 RAB34Q9BZG1 259 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRK-208ENST00000392449 DNM3Q9UQ16 869 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRK-208ENST00000392449 DOCK8Q8NF50 2099 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRK-208ENST00000392449 USP34Q70CQ2 3546 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRK-208ENST00000392449 CLUHO75153 1309 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRK-208ENST00000392449 K7ERI5 159 aa18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms