RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 RAP2AP10114 183 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 SYN1P17600 705 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 GNAT2P19087 354 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 DDCP20711 480 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 IL12RB1P42701 662 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 FLT3LGP49771 235 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 PTH1RQ03431 593 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP3.48□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 SP140Q13342 867 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 MTM1Q13496 603 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 GRM7Q14831 915 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 RAB39AQ14964 217 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATP2B3Q16720 1220 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM214AQ32MH5 1076 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 FKBP15Q5T1M5 1219 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 MFSD5Q6N075 450 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 TCTN3Q6NUS6 607 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM111BQ6SJ93 734 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 B3GNT9Q6UX72 402 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZBTB34Q8NCN2 500 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC35G2Q8TBE7 412 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 RUNDC1Q96C34 613 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 CEP95Q96GE4 821 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 CLPTM1LQ96KA5 538 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 PCGF6Q9BYE7 350 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 ENKD1Q9H0I2 346 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRDM11Q9NQV5 511 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 C1orf112Q9NSG2 853 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLA2G3Q9NZ20 509 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 H3BML4 177 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC16A6O15403 523 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 GPR42O15529 346 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRC1O43663 620 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 STC2O76061 302 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 IPO13O94829 963 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 AMY1AP04745 511 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 MYBP10242 640 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 HOXA5P20719 270 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 FPR1P21462 350 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 PCSK1P29120 753 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 ALDH1A3P47895 512 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 TBX4P57082 545 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 DSC2Q02487 901 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 NFIXQ14938 502 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC157Q569K6 752 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 MFSD14BQ5SR56 506 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 ERICH6BQ5W0A0 696 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 AFMIDQ63HM1 303 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 LIMS2Q7Z4I7 341 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 POLNQ7Z5Q5 900 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 FUKQ8N0W3 1084 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 D2HGDHQ8N465 521 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 C3orf20Q8ND61 904 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 IFI44Q8TCB0 444 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 STON2Q8WXE9 905 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 MRGPRX4Q96LA9 322 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 SAMD11Q96NU1 681 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 MPHOSPH9Q99550 1183 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 BDH2Q9BUT1 245 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM204AQ9H8W3 233 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAN1C1Q9NR34 630 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 OBP2AQ9NY56 170 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 HDAC5Q9UQL6 1122 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 POLHQ9Y253 713 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACTL7AQ9Y615 435 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZMYM3Q14202 1370 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRRC14BA6NHZ5 514 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM227AF5H4B4 570 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 PJA2O43164 708 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 FOXS1O43638 330 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARIH2O95376 493 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 ALDH2P05091 517 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 ITGB3P05106 788 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 CD1AP06126 327 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATP5JP18859 108 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 SMARCA1P28370 1054 aa3.46□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms