RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354376.3

C9orf163-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 163, humanhuman

Gene C9orf163, Length 2,572 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf163-201ENST00000354376 TTI1O43156 1089 aa24.29■■□□□ 1.48
C9orf163-201ENST00000354376 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
C9orf163-201ENST00000354376 C2CD6Q53TS8 623 aa24.29■■□□□ 1.48
C9orf163-201ENST00000354376 NT5C1BQ96P26 610 aa24.29■■□□□ 1.48
C9orf163-201ENST00000354376 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa24.29■■□□□ 1.48
C9orf163-201ENST00000354376 KRT5P13647 590 aa24.28■■□□□ 1.48
C9orf163-201ENST00000354376 LLGL1Q15334 1064 aa24.28■■□□□ 1.48
C9orf163-201ENST00000354376 CHST13Q8NET6 341 aa24.28■■□□□ 1.48
C9orf163-201ENST00000354376 TMC2Q8TDI7 906 aa24.28■■□□□ 1.48
C9orf163-201ENST00000354376 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
C9orf163-201ENST00000354376 CEP89Q96ST8 783 aa24.28■■□□□ 1.48
C9orf163-201ENST00000354376 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
C9orf163-201ENST00000354376 PMM2O15305 246 aa24.28■■□□□ 1.48
C9orf163-201ENST00000354376 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP24.28■■□□□ 1.48
C9orf163-201ENST00000354376 ATG7O95352 703 aa24.28■■□□□ 1.48
C9orf163-201ENST00000354376 KRT14P02533 472 aa24.28■■□□□ 1.48
C9orf163-201ENST00000354376 GPC5P78333 572 aa24.28■■□□□ 1.48
C9orf163-201ENST00000354376 PAK2Q13177 524 aa24.28■■□□□ 1.48
C9orf163-201ENST00000354376 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP24.28■■□□□ 1.48
C9orf163-201ENST00000354376 TMEM63BQ5T3F8 832 aa24.28■■□□□ 1.48
C9orf163-201ENST00000354376 PIK3R5Q8WYR1 880 aa24.28■■□□□ 1.48
C9orf163-201ENST00000354376 SPATC1LQ9H0A9 340 aa24.28■■□□□ 1.48
C9orf163-201ENST00000354376 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa24.28■■□□□ 1.48
C9orf163-201ENST00000354376 PTPRFP10586 1907 aa24.28■■□□□ 1.48
C9orf163-201ENST00000354376 RTN2O75298 545 aa24.27■■□□□ 1.48
C9orf163-201ENST00000354376 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
C9orf163-201ENST00000354376 HARSP12081 509 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
C9orf163-201ENST00000354376 FLT3P36888 993 aa24.27■■□□□ 1.48
C9orf163-201ENST00000354376 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
C9orf163-201ENST00000354376 LLGL2Q6P1M3 1020 aa24.27■■□□□ 1.48
C9orf163-201ENST00000354376 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
C9orf163-201ENST00000354376 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
C9orf163-201ENST00000354376 STAM2O75886 525 aa24.27■■□□□ 1.48
C9orf163-201ENST00000354376 ARIH2O95376 493 aa24.27■■□□□ 1.48
C9orf163-201ENST00000354376 MARK3P27448 753 aa24.27■■□□□ 1.48
C9orf163-201ENST00000354376 TRIM50Q86XT4 487 aa24.27■■□□□ 1.48
C9orf163-201ENST00000354376 DNERQ8NFT8 737 aa24.27■■□□□ 1.48
C9orf163-201ENST00000354376 TRIM51Q9BSJ1 452 aa24.27■■□□□ 1.48
C9orf163-201ENST00000354376 TRIM31Q9BZY9 425 aa24.27■■□□□ 1.48
C9orf163-201ENST00000354376 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
C9orf163-201ENST00000354376 TXNRD2Q9NNW7 524 aa24.27■■□□□ 1.48
C9orf163-201ENST00000354376 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
C9orf163-201ENST00000354376 ZNF233A6NK53 670 aa24.26■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 COMTP21964 271 aa24.26■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 ICAM3P32942 547 aa24.26■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 TTMPQ5BVD1 217 aa24.26■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 AFAP1L1Q8TED9 768 aa24.26■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 PORCNQ9H237 461 aa24.26■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa24.26■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 DAPK3O43293 454 aa24.26■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 GRIN3BO60391 1043 aa24.26■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 TNNI1P19237 187 aa24.26■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 GARTP22102 1010 aa24.26■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 RTP1P59025 263 aa24.26■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 FMNL3Q8IVF7 1028 aa24.26■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 ZBTB10Q96DT7 871 aa24.26■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 FBXO40Q9UH90 709 aa24.26■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 CSADQ9Y600 493 aa24.26■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 MYPNQ86TC9 1320 aa24.26■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 RIOX2Q8IUF8 465 aa24.25■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 DPH5Q9H2P9 285 aa24.25■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 EXTL3O43909 919 aa24.25■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 CNMDO75829 334 aa24.25■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 CFHP08603 1231 aa24.25■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 Q3C1V9 767 aa24.25■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 KCTD16Q68DU8 428 aa24.25■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 RHOT2Q8IXI1 618 aa24.25■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa24.25■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 SH2D3CQ8N5H7 860 aa24.25■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 NUP85Q9BW27 656 aa24.25■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 TRIM7Q9C029 511 aa24.25■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 PSD3Q9NYI0 1048 aa24.25■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 ARL2P36404 184 aa24.24■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 CCDC125Q86Z20 511 aa24.24■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 DEPTORQ8TB45 409 aa24.24■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 ZNF653Q96CK0 615 aa24.24■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 OTOFQ9HC10 1997 aa24.24■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 K7ERI5 159 aa24.24■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 VNN1O95497 513 aa24.24■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 GGPS1O95749 300 aa24.24■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 PDE6CP51160 858 aa24.24■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 CDR2Q01850 454 aa24.24■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 STRN3Q13033 797 aa24.24■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 FOXR1Q6PIV2 292 aa24.24■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa24.24■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 SULF1Q8IWU6 871 aa24.24■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 GLG1Q92896 1179 aa24.24■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 SH3GL2Q99962 352 aa24.24■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 TRPC6Q9Y210 931 aa24.24■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 HSF2BPO75031 334 aa24.23■■□□□ 1.47
C9orf163-201ENST00000354376 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.3 ms