RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340994.4

PKHD1-201, Transcript of PKHD1, fibrocystin/polyductin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PKHD1, Length 11,589 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1-201ENST00000340994 KMT5AQ9NQR1 393 aa8.67□□□□□ -1.02
PKHD1-201ENST00000340994 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PKHD1-201ENST00000340994 ATP1A3P13637 1013 aa8.66□□□□□ -1.02
PKHD1-201ENST00000340994 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PKHD1-201ENST00000340994 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PKHD1-201ENST00000340994 VPS33BQ9H267 617 aa8.66□□□□□ -1.02
PKHD1-201ENST00000340994 ZSCAN32Q9NX65 697 aa8.66□□□□□ -1.02
PKHD1-201ENST00000340994 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PKHD1-201ENST00000340994 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PKHD1-201ENST00000340994 TCF3P15923 654 aa8.66□□□□□ -1.02
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PKHD1-201ENST00000340994 ATAD3BQ5T9A4 648 aa8.66□□□□□ -1.02
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PKHD1-201ENST00000340994 FAM9CQ8IZT9 166 aa8.66□□□□□ -1.02
PKHD1-201ENST00000340994 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PKHD1-201ENST00000340994 PLEKHA8Q96JA3 519 aa8.66□□□□□ -1.02
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PKHD1-201ENST00000340994 ADAM22Q9P0K1 906 aa8.66□□□□□ -1.02
PKHD1-201ENST00000340994 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
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PKHD1-201ENST00000340994 CCDC28BQ9BUN5 200 aa8.66□□□□□ -1.02
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PKHD1-201ENST00000340994 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
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PKHD1-201ENST00000340994 MED26O95402 600 aa8.66□□□□□ -1.02
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PKHD1-201ENST00000340994 PPP2R3CQ969Q6 453 aa8.66□□□□□ -1.02
PKHD1-201ENST00000340994 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
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PKHD1-201ENST00000340994 CENPXA8MT69 81 aa8.66□□□□□ -1.02
PKHD1-201ENST00000340994 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PKHD1-201ENST00000340994 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PKHD1-201ENST00000340994 RXRGP48443 463 aa8.66□□□□□ -1.02
PKHD1-201ENST00000340994 ERICH1Q86X53 443 aa8.66□□□□□ -1.02
PKHD1-201ENST00000340994 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
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PKHD1-201ENST00000340994 TMEM35BQ8NCS4 154 aa8.66□□□□□ -1.02
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PKHD1-201ENST00000340994 IMPAD1Q9NX62 359 aa8.66□□□□□ -1.02
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PKHD1-201ENST00000340994 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PKHD1-201ENST00000340994 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PKHD1-201ENST00000340994 TTLL1O95922 423 aa8.66□□□□□ -1.02
PKHD1-201ENST00000340994 PRAMEP78395 509 aa8.66□□□□□ -1.02
PKHD1-201ENST00000340994 WASHC2DQ5SRD0 308 aa8.66□□□□□ -1.02
PKHD1-201ENST00000340994 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
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PKHD1-201ENST00000340994 GOLGA8SH3BPF8 625 aa8.65□□□□□ -1.02
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PKHD1-201ENST00000340994 ADD1P35611 737 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PKHD1-201ENST00000340994 KRT17Q04695 432 aa8.65□□□□□ -1.02
PKHD1-201ENST00000340994 DMPKQ09013 629 aa8.65□□□□□ -1.02
PKHD1-201ENST00000340994 RBBP7Q16576 425 aa8.65□□□□□ -1.02
PKHD1-201ENST00000340994 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PKHD1-201ENST00000340994 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
PKHD1-201ENST00000340994 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa8.65□□□□□ -1.02
PKHD1-201ENST00000340994 MAFGO15525 162 aa8.65□□□□□ -1.02
PKHD1-201ENST00000340994 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
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