RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332503.5

HOXB4-201, Transcript of homeobox B4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB4, Length 3,757 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4-201ENST00000332503 LRRC14Q15048 493 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 TAOK1Q7L7X3 1001 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP16.07■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 EPS8L1Q8TE68 723 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 KLHL29Q96CT2 875 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 TIPINQ9BVW5 301 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 DNAJC6O75061 913 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 RWDD2BP57060 319 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 RINT1Q6NUQ1 792 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 KBTBD2Q8IY47 623 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 DAW1Q8N136 415 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 OGFOD1Q8N543 542 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 UMODL1Q5DID0 1318 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 ZBTB5O15062 677 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 CALUO43852 315 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 ARHGEF19Q8IW93 802 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP16.07■□□□□ 0.162e-6■□□□□ 10.4
HOXB4-201ENST00000332503 SHMT1P34896 483 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 FMO1Q01740 532 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 PDK4Q16654 411 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP16.06■□□□□ 0.163e-6■■■■■ 37.6
HOXB4-201ENST00000332503 MKL1Q969V6 931 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 TRIM31Q9BZY9 425 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 ITIH2P19823 946 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 SREBF1P36956 1147 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 C4orf50Q6ZRC1 276 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 KRT82Q9NSB4 513 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 PCMTD2Q9NV79 361 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 CD2APQ9Y5K6 639 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 CNGA1P29973 690 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 DLGAP5Q15398 846 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 ZNF720Q7Z2F6 126 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 SELENOSQ9BQE4 189 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 MAPK13O15264 365 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 ATP5HO75947 161 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 C1QAP02745 245 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 DHRS4L1P0CG22 281 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 WDR66Q8TBY9 1149 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 ZNF398Q8TD17 642 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 SKA1Q96BD8 255 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 HAPLN3Q96S86 360 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 TTBK2Q6IQ55 1244 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 TTC8Q8TAM2 541 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 ZBED4O75132 1171 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 UPP2O95045 317 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 IFNAR2P48551 515 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 CREB5Q02930 508 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 SPOCK2Q92563 424 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 KREMEN1Q96MU8 473 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 NMRK1Q9NWW6 199 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 PLA2G4CQ9UP65 541 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 C2CD2LO14523 706 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 SLCO1A2P46721 670 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 SYDE2Q5VT97 1194 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 UCMAQ8WVF2 138 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 UBN1Q9NPG3 1134 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 STX8Q9UNK0 236 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 RNF8O76064 485 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 RFWD3Q6PCD5 774 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 SAR1AQ9NR31 198 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 KLHL14Q9P2G3 628 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 FETUBQ9UGM5 382 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 COQ4Q9Y3A0 265 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 RLFQ13129 1914 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 FDX1P10109 184 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 AKR1B1P15121 316 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 DLG4P78352 724 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 GRIPAP1Q4V328 841 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 IRGCQ6NXR0 463 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 SLFN12Q8IYM2 578 aa16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms