RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 H2AFVQ71UI9 128 aa19.33■□□□□ 0.68
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ACTB-201ENST00000331789 PARD6BQ9BYG5 372 aa19.29■□□□□ 0.68
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ACTB-201ENST00000331789 ATP8B3O60423 1300 aa19.29■□□□□ 0.68
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ACTB-201ENST00000331789 H3BRB1 525 aa19.28■□□□□ 0.68
ACTB-201ENST00000331789 ASAP2O43150 1006 aa19.28■□□□□ 0.68
ACTB-201ENST00000331789 MMP3P08254 477 aa19.28■□□□□ 0.68
ACTB-201ENST00000331789 CLCN6P51797 869 aa19.28■□□□□ 0.68
ACTB-201ENST00000331789 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
ACTB-201ENST00000331789 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
ACTB-201ENST00000331789 MEI1Q5TIA1 1274 aa19.28■□□□□ 0.68
ACTB-201ENST00000331789 TAF3Q5VWG9 929 aa19.28■□□□□ 0.68
ACTB-201ENST00000331789 LINC01465Q8N7H1 131 aa19.28■□□□□ 0.68
ACTB-201ENST00000331789 OR5B17Q8NGF7 314 aa19.28■□□□□ 0.68
ACTB-201ENST00000331789 PCDHB18PQ96TA0 734 aa19.28■□□□□ 0.68
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