RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000303927.3

CAVIN3-201, Transcript of caveolae associated protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAVIN3, Length 1,174 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3-201ENST00000303927 PANK2Q9BZ23 570 aa22■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 CUEDC2Q9H467 287 aa22■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 FAM13BQ9NYF5 915 aa22■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 SPG21Q9NZD8 308 aa22■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 TNFSF13BQ9Y275 285 aa22■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa22■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 GIT1Q9Y2X7 761 aa22■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 MUC6Q6W4X9 2439 aa22■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa21.99■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 A0A087X0B3 334 aa21.99■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 EDN1P05305 212 aa21.99■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 ABCD1P33897 745 aa21.99■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 NCKAP1LP55160 1127 aa21.99■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 STRN3Q13033 797 aa21.99■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 KCNC3Q14003 757 aa21.99■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 LLGL2Q6P1M3 1020 aa21.99■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa21.99■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 MYCT1Q8N699 235 aa21.99■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa21.99■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 SUSD6Q92537 303 aa21.99■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa21.99■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 MFSD14AQ96MC6 490 aa21.99■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 TTLL13PA6NNM8 815 aa21.98■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 INPPL1O15357 1258 aa21.98■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 MAPTP10636 758 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 NT5DC1Q5TFE4 455 aa21.98■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 RESP18Q5W5W9 173 aa21.98■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 ANKRD54Q6NXT1 300 aa21.98■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 TAS1R3Q7RTX0 852 aa21.98■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 TMC7Q7Z402 723 aa21.98■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 IQUBQ8NA54 791 aa21.98■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 DDX12PQ92771 950 aa21.98■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 LRRC27Q9C0I9 530 aa21.98■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 ZHX3Q9H4I2 956 aa21.98■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 TBC1D13Q9NVG8 400 aa21.98■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 HES2Q9Y543 173 aa21.98■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 MYMKA6NI61 221 aa21.97■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 TRAK2O60296 914 aa21.97■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 E2F4Q16254 413 aa21.97■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 DYMQ7RTS9 669 aa21.97■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 HAUS6Q7Z4H7 955 aa21.97■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 SLC39A11Q8N1S5 342 aa21.97■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 APOL6Q9BWW8 343 aa21.97■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 KCNH6Q9H252 994 aa21.97■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 RNF39Q9H2S5 420 aa21.97■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 TNMDQ9H2S6 317 aa21.97■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 MAGEF1Q9HAY2 307 aa21.97■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 USP20Q9Y2K6 914 aa21.97■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 K7ENM7 598 aa21.96■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 MLH1P40692 756 aa21.96■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 EEF1DP3Q658K8 133 aa21.96■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 TRIM67Q6ZTA4 783 aa21.96■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 FBXL18Q96ME1 805 aa21.96■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 S1PR5Q9H228 398 aa21.96■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 SEL1LQ9UBV2 794 aa21.96■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 PARP2Q9UGN5 583 aa21.96■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 TRIP11Q15643 1979 aa21.96■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 CITO14578 2027 aa21.96■■□□□ 1.11
CAVIN3-201ENST00000303927 ARL5CA6NH57 179 aa21.95■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP21.95■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 GAP43P17677 238 aa21.95■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 AKAP5P24588 427 aa21.95■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 BCAR1P56945 870 aa21.95■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 ZXDAP98168 799 aa21.95■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 AMPD3Q01432 767 aa21.95■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 ZNF568Q3ZCX4 644 aa21.95■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 ADALQ6DHV7 355 aa21.95■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 ZPBP2Q6X784 338 aa21.95■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 DHX58Q96C10 678 aa21.95■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 DNAJC19Q96DA6 116 aa21.95■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 GAD1Q99259 594 aa21.95■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 APOL5Q9BWW9 433 aa21.95■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa21.95■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 TECTAO75443 2155 aa21.94■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 TMEM221A6NGB7 291 aa21.94■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa21.94■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 M0R296 226 aa21.94■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 NHLH1Q02575 133 aa21.94■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 SYCE2Q6PIF2 218 aa21.94■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 RPS6KC1Q96S38 1066 aa21.94■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 TMEM175Q9BSA9 504 aa21.94■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 TCHPQ9BT92 498 aa21.94■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa21.94■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 PTPRHQ9HD43 1115 aa21.94■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 KBTBD4Q9NVX7 518 aa21.94■■□□□ 1.1
CAVIN3-201ENST00000303927 TBX20Q9UMR3 447 aa21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.7 ms