RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 CTAGE4Q8IX94 777 aa24.59■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 TATDN2Q93075 761 aa24.59■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 BTNL10A8MVZ5 291 aa24.58■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 ADCY6O43306 1168 aa24.58■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 H2AFZP0C0S5 128 aa24.58■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 MFAP3P55082 362 aa24.58■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 DUSP28Q4G0W2 176 aa24.58■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF484Q5JVG2 852 aa24.58■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 H2AFVQ71UI9 128 aa24.58■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 PALB2Q86YC2 1186 aa24.58■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 RABGGTAQ92696 567 aa24.58■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 MMS19Q96T76 1030 aa24.58■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 AGPAT1Q99943 283 aa24.58■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 TCHPQ9BT92 498 aa24.58■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 TOM1L1O75674 476 aa24.57■■□□□ 1.52
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VSTM4-201ENST00000298454 TNFAIP3P21580 790 aa24.57■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 ZACNQ401N2 412 aa24.57■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 FAM71AQ8IYT1 594 aa24.57■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 C2orf40Q9H1Z8 148 aa24.57■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa24.57■■□□□ 1.52
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VSTM4-201ENST00000298454 PPFIA4O75335 1185 aa24.57■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 TNFSF9P41273 254 aa24.57■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 NFRKBQ6P4R8 1299 aa24.57■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 SAPCD2Q86UD0 394 aa24.57■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 SHC3Q92529 594 aa24.57■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 PSMB7Q99436 277 aa24.57■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 TLR10Q9BXR5 811 aa24.57■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 ACP6Q9NPH0 428 aa24.57■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 FAM189A1O60320 539 aa24.56■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 SGPL1O95470 568 aa24.56■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 GALCP54803 685 aa24.56■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 TFDP1Q14186 410 aa24.56■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa24.56■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 MORN1Q5T089 497 aa24.56■■□□□ 1.52
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VSTM4-201ENST00000298454 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 OR6J1Q8NGC5 347 aa24.56■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 TAS2R14Q9NYV8 317 aa24.56■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa24.56■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 GRID2IPA4D2P6 1211 aa24.56■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa24.56■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 CYP26A1O43174 497 aa24.56■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 FTCDO95954 541 aa24.56■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 COG1Q8WTW3 980 aa24.56■■□□□ 1.52
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VSTM4-201ENST00000298454 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
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VSTM4-201ENST00000298454 H3BRB1 525 aa24.55■■□□□ 1.52
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VSTM4-201ENST00000298454 MMP3P08254 477 aa24.55■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 CXCR5P32302 372 aa24.55■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 NOP2P46087 812 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
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VSTM4-201ENST00000298454 OSBPL9Q96SU4 736 aa24.55■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 FZD8Q9H461 694 aa24.55■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 MINDY3Q9H8M7 445 aa24.55■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 INTUQ9ULD6 942 aa24.55■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 ATP8B3O60423 1300 aa24.55■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 ABLIM1O14639 778 aa24.54■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 VNN1O95497 513 aa24.54■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 PRLRP16471 622 aa24.54■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 PTENP60484 403 aa24.54■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 IQSEC1Q6DN90 963 aa24.54■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 SLC47A2Q86VL8 602 aa24.54■■□□□ 1.52
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VSTM4-201ENST00000298454 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 PPP1R16BQ96T49 567 aa24.54■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 SLC5A4Q9NY91 659 aa24.54■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 HYOU1Q9Y4L1 999 aa24.54■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 TRPM7Q96QT4 1865 aa24.54■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 HLA-DRAP01903 254 aa24.54■■□□□ 1.52
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VSTM4-201ENST00000298454 MBTD1Q05BQ5 628 aa24.54■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 MAP2K5Q13163 448 aa24.54■■□□□ 1.52
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VSTM4-201ENST00000298454 CREG2Q8IUH2 290 aa24.54■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 OR5B17Q8NGF7 314 aa24.54■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 EPS8L1Q8TE68 723 aa24.54■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 MAP7D2Q96T17 732 aa24.54■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 CGRRF1Q99675 332 aa24.54■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 FLRT1Q9NZU1 646 aa24.54■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 ACKR2O00590 384 aa24.53■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 ASAP2O43150 1006 aa24.53■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 ABCB4P21439 1286 aa24.53■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 PIK3CAP42336 1068 aa24.53■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 MCL1Q07820 350 aa24.53■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 LINC01465Q8N7H1 131 aa24.53■■□□□ 1.52
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