RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296031.4

CXCL2-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXCL2, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2-201ENST00000296031 CMA1P23946 247 aa27.35■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 GRM5P41594 1212 aa27.35■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP27.35■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 OR1G1P47890 313 aa27.35■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 OSTNP61366 133 aa27.35■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 AMPD3Q01432 767 aa27.35■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 PLPP4Q5VZY2 271 aa27.35■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF720Q7Z2F6 126 aa27.35■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa27.35■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 PPP2R3CQ969Q6 453 aa27.35■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 TCF25Q9BQ70 676 aa27.35■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 COG5Q9UP83 839 aa27.35■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 BRWD1Q9NSI6 2320 aa27.35■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 FRMD3A2A2Y4 597 aa27.34■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 FSCN2O14926 492 aa27.34■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 CLDN3O15551 220 aa27.34■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 LIG4P49917 911 aa27.34■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 TFF2Q03403 129 aa27.34■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 HYAL1Q12794 435 aa27.34■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP27.34■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 TMC7Q7Z402 723 aa27.34■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 CXCL16Q9H2A7 254 aa27.34■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 IGFLR1Q9H665 355 aa27.34■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 MAGEF1Q9HAY2 307 aa27.34■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 PANK4Q9NVE7 773 aa27.34■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 TBC1D7Q9P0N9 293 aa27.34■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 A0A0C4DFX4 3053 aa27.33■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 PTGESO14684 152 aa27.33■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 NR1I2O75469 434 aa27.33■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 PIGRP01833 764 aa27.33■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 YARSP54577 528 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 MCL1Q07820 350 aa27.33■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 EP400NLQ6ZTU2 488 aa27.33■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 MAP4K3Q8IVH8 894 aa27.33■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 TRIM9Q9C026 710 aa27.33■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 OLFML3Q9NRN5 406 aa27.33■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 CITO14578 2027 aa27.33■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 XIRP2A4UGR9 3374 aa27.32■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 NCK2O43639 380 aa27.32■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP27.32■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 CCDC65Q8IXS2 484 aa27.32■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 VPS52Q8N1B4 723 aa27.32■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 A0A1B0GVL5 298 aa27.31■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 THP07101 528 aa27.31■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 CA8P35219 290 aa27.31■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 NRIP1P48552 1158 aa27.31■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 COL19A1Q14993 1142 aa27.31■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 TPRNQ4KMQ1 711 aa27.31■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 HVCN1Q96D96 273 aa27.31■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 ACAP3Q96P50 834 aa27.31■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 STRA6Q9BX79 667 aa27.31■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 GDPD2Q9HCC8 539 aa27.31■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 CLDND1Q9NY35 253 aa27.31■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 PPP1R37O75864 691 aa27.3■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 PFKFB1P16118 471 aa27.3■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 ASIC1P78348 528 aa27.3■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 TUSC3Q13454 348 aa27.3■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 SEZ6Q53EL9 994 aa27.3■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 GLRA4Q5JXX5 417 aa27.3■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 CNNM4Q6P4Q7 775 aa27.3■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 CEP57L1Q8IYX8 460 aa27.3■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 C7orf25Q9BPX7 421 aa27.3■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 COLEC11Q9BWP8 271 aa27.3■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 VN1R3Q9BXE9 311 aa27.3■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 HAPLN2Q9GZV7 340 aa27.3■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 TLE6Q9H808 572 aa27.3■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 MARCH5Q9NX47 278 aa27.3■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 CACNG4Q9UBN1 327 aa27.3■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 STK39Q9UEW8 545 aa27.3■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 F8W810 466 aa27.29■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 GCNT3O95395 438 aa27.29■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 SLFN14P0C7P3 912 aa27.29■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 KCNA5P22460 613 aa27.29■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 ALKAL1Q6UXT8 129 aa27.29■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 RABGGTAQ92696 567 aa27.29■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 ZBP1Q9H171 429 aa27.29■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 HPSEQ9Y251 543 aa27.29■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa27.29■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 CASTOR2A6NHX0 329 aa27.28■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 HIDE1A8MVS5 230 aa27.28■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 PER2O15055 1255 aa27.28■■□□□ 1.96
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