RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 IDI2Q9BXS1 227 aa16■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 EBF2Q9HAK2 575 aa16■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 KCNQ5Q9NR82 932 aa16■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 WHRNQ9P202 907 aa16■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 CLDN3O15551 220 aa15.99■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 CYP26A1O43174 497 aa15.99■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 SCP2P22307 547 aa15.99■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 KRT17Q04695 432 aa15.99■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 C1orf54Q8WWF1 131 aa15.99■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 SLCO2A1Q92959 643 aa15.99■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 KREMEN1Q96MU8 473 aa15.99■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 ZNF577Q9BSK1 485 aa15.99■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 ECT2Q9H8V3 914 aa15.99■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa15.99■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 UBR3Q6ZT12 1888 aa15.99■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 FOXO6A8MYZ6 492 aa15.99■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 GH2P01242 217 aa15.99■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 RPSAP08865 295 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 RASA3Q14644 834 aa15.99■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 CEP55Q53EZ4 464 aa15.99■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 B3GNT9Q6UX72 402 aa15.99■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 KIAA0825Q8IV33 1275 aa15.99■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 ZNF653Q96CK0 615 aa15.99■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 TMEM117Q9H0C3 514 aa15.99■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 MLXIPLQ9NP71 852 aa15.99■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 NRXN2Q9P2S2 1712 aa15.98■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 ALADP13716 330 aa15.98■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 NUGGCQ68CJ6 796 aa15.98■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 PADI6Q6TGC4 694 aa15.98■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 NSMFQ6X4W1 530 aa15.98■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 WDR11Q9BZH6 1224 aa15.98■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 TMEM206Q9H813 350 aa15.98■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 GTF3C4Q9UKN8 822 aa15.98■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 L3MBTL1Q9Y468 752 aa15.98■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 FSCN2O14926 492 aa15.97■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 SUN1O94901 812 aa15.97■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 POLR2MP0CAP2 368 aa15.97■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 BNIP1Q12981 228 aa15.97■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 SNX1Q13596 522 aa15.97■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 ANKRD42Q8N9B4 389 aa15.97■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 AGAP11Q8TF27 550 aa15.97■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 TMEM174Q8WUU8 243 aa15.97■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 CKAP2Q8WWK9 683 aa15.97■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 HSPBP1Q9NZL4 362 aa15.97■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 G3V3G9 751 aa15.97■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 MXI1P50539 228 aa15.97■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP15.97■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 MPP2Q14168 576 aa15.97■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 SGO2Q562F6 1265 aa15.97■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 DCAF8Q5TAQ9 597 aa15.97■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 C12orf56Q8IXR9 622 aa15.97■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 PPM1KQ8N3J5 372 aa15.97■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 XXYLT1Q8NBI6 393 aa15.97■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 CCHCR1Q8TD31 782 aa15.97■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 TEKT3Q9BXF9 490 aa15.97■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 UVRAGQ9P2Y5 699 aa15.97■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 ASIC3Q9UHC3 531 aa15.97■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 CEP83Q9Y592 693 aa15.97■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP15.96■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 GJB6O95452 261 aa15.96■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 GH1P01241 217 aa15.96■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 ITIH2P19823 946 aa15.96■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 IVDP26440 423 aa15.96■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 ATP5DP30049 168 aa15.96■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 STAT2P52630 851 aa15.96■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 COPS2P61201 443 aa15.96■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 SHC3Q92529 594 aa15.96■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 ACCSQ96QU6 501 aa15.96■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 KCNK9Q9NPC2 374 aa15.96■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 CHST7Q9NS84 486 aa15.96■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 USP20Q9Y2K6 914 aa15.96■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 TTC4O95801 387 aa15.96■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 VIL1P09327 827 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 CYP11B1P15538 503 aa15.96■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 MYO1EQ12965 1108 aa15.96■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 CRYMQ14894 314 aa15.96■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 CCDC174Q6PII3 467 aa15.96■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 SPATA21Q7Z572 469 aa15.96■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 GDAP1Q8TB36 358 aa15.96■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 NSMCE1Q8WV22 266 aa15.96■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 SEMA4DQ92854 862 aa15.96■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 DBNDD1Q9H9R9 158 aa15.96■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 PRKAG3Q9UGI9 489 aa15.96■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 PNMA3Q9UL41 463 aa15.96■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa15.96■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 ANP32DO95626 131 aa15.95■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 ITGA8P53708 1063 aa15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms