RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 NRLP54845 237 aa9.31□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 PTENP60484 403 aa9.31□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 PPP2R2AP63151 447 aa9.31□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 PPP1R7Q15435 360 aa9.31□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 DUPD1Q68J44 220 aa9.31□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 RNF207Q6ZRF8 634 aa9.31□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 CPLX4Q7Z7G2 160 aa9.31□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 SYCE1Q8N0S2 351 aa9.31□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa9.31□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 ZSWIM1Q9BR11 485 aa9.31□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 TBX20Q9UMR3 447 aa9.31□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 DOCK5Q9H7D0 1870 aa9.31□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 PIK3R2O00459 728 aa9.31□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 TNNI1P19237 187 aa9.31□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 MARK3P27448 753 aa9.31□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
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GINS1-201ENST00000262460 B3GNT9Q6UX72 402 aa9.31□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 ZBTB33Q86T24 672 aa9.31□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 TTLL6Q8N841 843 aa9.31□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa9.31□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 PPM1EQ8WY54 764 aa9.31□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 C9orf72Q96LT7 481 aa9.31□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 OSBPL7Q9BZF2 842 aa9.31□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 RNF19AQ9NV58 838 aa9.31□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 HAUS2Q9NVX0 235 aa9.31□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 ASIC3Q9UHC3 531 aa9.31□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 ATRNL1Q5VV63 1379 aa9.3□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 LRRC37AA6NMS7 1700 aa9.3□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 RGS20O76081 388 aa9.3□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 YY1P25490 414 aa9.3□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 PTGIRP43119 386 aa9.3□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 PEX5P50542 639 aa9.3□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 MNAT1P51948 309 aa9.3□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 CNTN2Q02246 1040 aa9.3□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 KIF22Q14807 665 aa9.3□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 SLC15A2Q16348 729 aa9.3□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 KYNUQ16719 465 aa9.3□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa9.3□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 HELQQ8TDG4 1101 aa9.3□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 LRRC45Q96CN5 670 aa9.3□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 STRA6Q9BX79 667 aa9.3□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
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GINS1-201ENST00000262460 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
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GINS1-201ENST00000262460 TMEM63BQ5T3F8 832 aa9.3□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 CYP4F22Q6NT55 531 aa9.3□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 MREGQ8N565 214 aa9.3□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 PARD3BQ8TEW8 1205 aa9.3□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 GMLQ99445 158 aa9.3□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 PSMD1Q99460 953 aa9.3□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 PDCD2LQ9BRP1 358 aa9.3□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 HAPLN2Q9GZV7 340 aa9.3□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 RNF146Q9NTX7 359 aa9.3□□□□□ -0.92
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GINS1-201ENST00000262460 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
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GINS1-201ENST00000262460 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa9.29□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 STYK1Q6J9G0 422 aa9.29□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 DPH6Q7L8W6 267 aa9.29□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 TAS1R3Q7RTX0 852 aa9.29□□□□□ -0.92
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GINS1-201ENST00000262460 KIRREL3Q8IZU9 778 aa9.29□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 SEC16BQ96JE7 1060 aa9.29□□□□□ -0.92
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GINS1-201ENST00000262460 MYOZ2Q9NPC6 264 aa9.29□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 FEM1BQ9UK73 627 aa9.29□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 ODF2LQ9ULJ1 636 aa9.29□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 NCANO14594 1321 aa9.29□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa9.29□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa9.29□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 LRRIQ4A6NIV6 560 aa9.29□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 BTNL10A8MVZ5 291 aa9.29□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 HSD17B4P51659 736 aa9.29□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 TAS2R40P59535 323 aa9.29□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 KRT17Q04695 432 aa9.29□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 TMEM270Q6UE05 265 aa9.29□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 TRIM50Q86XT4 487 aa9.29□□□□□ -0.92
GINS1-201ENST00000262460 CYP4X1Q8N118 509 aa9.29□□□□□ -0.92
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