RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259365.8

TMOD1-201, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,343 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF449Q6P9G9 518 aa14.33□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 SUPT20HQ8NEM7 779 aa14.33□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 KREMEN1Q96MU8 473 aa14.33□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 NCAPGQ9BPX3 1015 aa14.33□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 FAM129AQ9BZQ8 928 aa14.33□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP14.33□□□□□ -0.11
TMOD1-201ENST00000259365 A8MUI8 341 aa14.33□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 PPFIA2O75334 1257 aa14.33□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 UPP2O95045 317 aa14.33□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa14.33□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 CTNNA2P26232 953 aa14.33□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 CNGA1P29973 690 aa14.33□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 TAOK1Q7L7X3 1001 aa14.33□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 C4orf33Q8N1A6 199 aa14.33□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 EPS8L1Q8TE68 723 aa14.33□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP14.33□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 RPTORQ8N122 1335 aa14.33□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 GOLGA8RI6L899 631 aa14.33□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 RIPK2O43353 540 aa14.33□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 CYP11B1P15538 503 aa14.33□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 YY1P25490 414 aa14.33□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP14.33□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 ACCSLQ4AC99 568 aa14.33□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 ERMARDQ5T6L9 678 aa14.33□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 TRIM68Q6AZZ1 485 aa14.33□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa14.33□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 MKL1Q969V6 931 aa14.33□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 HOMER3Q9NSC5 361 aa14.33□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa14.33□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa14.33□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 AFF2P51816 1311 aa14.32□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 H0Y3Z8 333 aa14.32□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 RALAP11233 206 aa14.32□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 QARSP47897 775 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 NOVP48745 357 aa14.32□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 MTERF2Q49AM1 385 aa14.32□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 DACT2Q5SW24 774 aa14.32□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 VSIG1Q86XK7 387 aa14.32□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 BORCS6Q96GS4 357 aa14.32□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 MASTLQ96GX5 879 aa14.32□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 SGSM3Q96HU1 749 aa14.32□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 GRHL1Q9NZI5 618 aa14.32□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 COL20A1Q9P218 1284 aa14.32□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP14.32□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 FAM187AA6NFU0 413 aa14.32□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP14.32□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 OSTNP61366 133 aa14.32□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 AUHQ13825 339 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 ARHGEF16Q5VV41 709 aa14.32□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM270Q6UE05 265 aa14.32□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa14.32□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 EXOC3L1Q86VI1 746 aa14.32□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 NLGN1Q8N2Q7 840 aa14.32□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa14.32□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 ECT2Q9H8V3 914 aa14.32□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 P4HBP07237 508 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 ETS1P14921 441 aa14.31□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 NSFP46459 744 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 ADCY2Q08462 1091 aa14.31□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 KIFAP3Q92845 792 aa14.31□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 RMDN3Q96TC7 470 aa14.31□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP14.31□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 TELO2Q9Y4R8 837 aa14.31□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 PODXLO00592 558 aa14.31□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 RARRES1P49788 294 aa14.31□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 STRIP1Q5VSL9 837 aa14.31□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 SWSAP1Q6NVH7 229 aa14.31□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 ANKMY2Q8IV38 441 aa14.31□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 MXRA8Q9BRK3 442 aa14.31□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 FAM167BQ9BTA0 163 aa14.31□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP14.31□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 GABBR1Q9UBS5 961 aa14.31□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa14.31□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa14.31□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 PHLPP1O60346 1717 aa14.31□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 LRRIQ4A6NIV6 560 aa14.31□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 BTNL10A8MVZ5 291 aa14.31□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 GAS8O95995 478 aa14.31□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 CFHP08603 1231 aa14.31□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP14.31□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa14.31□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 EEPD1Q7L9B9 569 aa14.31□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 GMCL1Q96IK5 515 aa14.31□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 PLVAPQ9BX97 442 aa14.31□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM206Q9H813 350 aa14.31□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 KIF9Q9HAQ2 790 aa14.31□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 NOD2Q9HC29 1040 aa14.31□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 SAYSD1Q9NPB0 183 aa14.31□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP14.31□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 INTUQ9ULD6 942 aa14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 219.6 ms