RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 PJA2O43164 708 aa16.94■□□□□ 0.3
CTIF-201ENST00000256413 OATP04181 439 aa16.94■□□□□ 0.3
CTIF-201ENST00000256413 KCNMA1Q12791 1236 aa16.94■□□□□ 0.3
CTIF-201ENST00000256413 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
CTIF-201ENST00000256413 ARHGEF16Q5VV41 709 aa16.94■□□□□ 0.3
CTIF-201ENST00000256413 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
CTIF-201ENST00000256413 PPP2R3CQ969Q6 453 aa16.94■□□□□ 0.3
CTIF-201ENST00000256413 IP6K2Q9UHH9 426 aa16.94■□□□□ 0.3
CTIF-201ENST00000256413 NEU2Q9Y3R4 380 aa16.94■□□□□ 0.3
CTIF-201ENST00000256413 NFIBO00712 420 aa16.94■□□□□ 0.3
CTIF-201ENST00000256413 COPAP53621 1224 aa16.94■□□□□ 0.3
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CTIF-201ENST00000256413 OMA1Q96E52 524 aa16.94■□□□□ 0.3
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CTIF-201ENST00000256413 FAM153AQ9UHL3 310 aa16.94■□□□□ 0.3
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CTIF-201ENST00000256413 CLK1P49759 484 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
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CTIF-201ENST00000256413 SLC34A1Q06495 639 aa16.93■□□□□ 0.3
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CTIF-201ENST00000256413 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
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CTIF-201ENST00000256413 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa16.92■□□□□ 0.3
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CTIF-201ENST00000256413 KLRC1P26715 233 aa16.92■□□□□ 0.3
CTIF-201ENST00000256413 ROR1Q01973 937 aa16.92■□□□□ 0.3
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CTIF-201ENST00000256413 STMN3Q9NZ72 180 aa16.92■□□□□ 0.3
CTIF-201ENST00000256413 NEMP1O14524 444 aa16.92■□□□□ 0.3
CTIF-201ENST00000256413 KRT16P08779 473 aa16.92■□□□□ 0.3
CTIF-201ENST00000256413 ABCD1P33897 745 aa16.92■□□□□ 0.3
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CTIF-201ENST00000256413 RTN2O75298 545 aa16.92■□□□□ 0.3
CTIF-201ENST00000256413 SLC1A1P43005 524 aa16.92■□□□□ 0.3
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CTIF-201ENST00000256413 LARGE2Q8N3Y3 721 aa16.92■□□□□ 0.3
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CTIF-201ENST00000256413 BCS1LQ9Y276 419 aa16.92■□□□□ 0.3
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CTIF-201ENST00000256413 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
CTIF-201ENST00000256413 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa16.92■□□□□ 0.3
CTIF-201ENST00000256413 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
CTIF-201ENST00000256413 HEATR4Q86WZ0 1026 aa16.92■□□□□ 0.3
CTIF-201ENST00000256413 INPP5DQ92835 1189 aa16.92■□□□□ 0.3
CTIF-201ENST00000256413 KRT7P08729 469 aa16.91■□□□□ 0.3
CTIF-201ENST00000256413 KCNA6P17658 529 aa16.91■□□□□ 0.3
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