RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249377.4

LRRC17-201, Transcript of leucine rich repeat containing 17, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRC17, Length 2,002 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17-201ENST00000249377 RMDN2Q96LZ7 410 aa14.55□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 MAGEB18Q96M61 343 aa14.55□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 PCDHB18PQ96TA0 734 aa14.55□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 STRA6Q9BX79 667 aa14.55□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 AMNQ9BXJ7 453 aa14.55□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 P4HA2O15460 535 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 SLITRK3O94933 977 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 UNC5CO95185 931 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 CYP1A2P05177 515 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 CHKAP35790 457 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 ATP11AP98196 1134 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 MTFR1Q15390 333 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 EPC2Q52LR7 807 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 ARHGEF19Q8IW93 802 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 FAM178BQ8IXR5 827 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 CCDC17Q96LX7 622 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 TRIM7Q9C029 511 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 PIM2Q9P1W9 311 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 BCS1LQ9Y276 419 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 KIF3CO14782 793 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 FSCN2O14926 492 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 GH1P01241 217 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 BRAFP15056 766 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 NPR1P16066 1061 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 CHRNB2P17787 502 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 KCNA3P22001 575 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 IVDP26440 423 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 RWDD2BP57060 319 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 LMNB2Q03252 620 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 KRT17Q04695 432 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 SLFN13Q68D06 897 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 ANKRD42Q8N9B4 389 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 CYP2W1Q8TAV3 490 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 TMEM174Q8WUU8 243 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 KCND2Q9NZV8 630 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 KLHL14Q9P2G3 628 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 ACTL7BQ9Y614 415 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 SIPA1L1O43166 1804 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 EXOC3O60645 756 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 BLMHQ13867 455 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 PTK6Q13882 451 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 LRCH2Q5VUJ6 765 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 OTOP1Q7RTM1 612 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 ECHDC2Q86YB7 292 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 CPNE8Q86YQ8 564 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 EPS8L1Q8TE68 723 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 SNF8Q96H20 258 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 DYDC2Q96IM9 177 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 KCNK9Q9NPC2 374 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 NYAP2Q9P242 653 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 POLLQ9UGP5 575 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 STK38LQ9Y2H1 464 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 USP20Q9Y2K6 914 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 EMSYQ7Z589 1322 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 SPOPO43791 374 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 HLA-DOAP06340 250 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 MUTP22033 750 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 STX2P32856 288 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 CAV1Q03135 178 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 PPP2R5CQ13362 524 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 PARP6Q2NL67 630 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 CRY2Q49AN0 593 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 FBXO11Q86XK2 927 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 GDAP1Q8TB36 358 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 SPDL1Q96EA4 605 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 NUP85Q9BW27 656 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 SLC24A3Q9HC58 644 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 MLXIPLQ9NP71 852 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 EURLQ9NYK6 297 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 UVRAGQ9P2Y5 699 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 GTF3C4Q9UKN8 822 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 TRIM33Q9UPN9 1127 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 LRRC37AA6NMS7 1700 aa14.52□□□□□ -0.08
LRRC17-201ENST00000249377 MYH11P35749 1972 aa14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms