RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa24.41■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD63C9JTQ0 380 aa24.41■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 MYBP10242 640 aa24.41■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 GRM5P41594 1212 aa24.41■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 PLCB3Q01970 1234 aa24.41■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 NAB2Q15742 525 aa24.41■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 ALKAL1Q6UXT8 129 aa24.41■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 CCDC65Q8IXS2 484 aa24.41■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 COLGALT2Q8IYK4 626 aa24.41■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 HACE1Q8IYU2 909 aa24.41■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 URGCPQ8TCY9 931 aa24.41■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 ZNF558Q96NG5 402 aa24.41■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 USP25Q9UHP3 1055 aa24.41■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 GDAQ9Y2T3 454 aa24.41■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 TISP43B9A030 160 aa24.4■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 KLRC4O43908 158 aa24.4■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 FAM189A1O60320 539 aa24.4■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP24.4■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 SLC11A1P49279 550 aa24.4■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 ASIC1P78348 528 aa24.4■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 XKR4Q5GH76 650 aa24.4■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 UNC13DQ70J99 1090 aa24.4■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 CEP57L1Q8IYX8 460 aa24.4■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 POF1BQ8WVV4 589 aa24.4■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 TCHPQ9BT92 498 aa24.4■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 GBP3Q9H0R5 595 aa24.4■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 LMAN2LQ9H0V9 348 aa24.4■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 STYXL1Q9Y6J8 313 aa24.4■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 ABCD1P33897 745 aa24.39■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP24.39■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa24.39■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 SEZ6Q53EL9 994 aa24.39■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 THNSL1Q8IYQ7 743 aa24.39■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 ENGASEQ8NFI3 743 aa24.39■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 HVCN1Q96D96 273 aa24.39■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 SPG21Q9NZD8 308 aa24.39■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa24.39■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 A0A0B4J269 797 aa24.38■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa24.38■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 CLDN3O15551 220 aa24.38■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 ZNF202O95125 648 aa24.38■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 IRS1P35568 1242 aa24.38■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 OSTNP61366 133 aa24.38■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 TMEM175Q9BSA9 504 aa24.38■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 NRP1O14786 923 aa24.37■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 GCNT3O95395 438 aa24.37■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 ADSSP30520 456 aa24.37■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 HOXD13P35453 343 aa24.37■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 LIG4P49917 911 aa24.37■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 ERVFC1P60507 584 aa24.37■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 UBE3AQ05086 875 aa24.37■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 GRIK3Q13003 919 aa24.37■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 PTPROQ16827 1216 aa24.37■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa24.37■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 KRBA2Q6ZNG9 492 aa24.37■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 PPM1EQ8WY54 764 aa24.37■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 BICD1Q96G01 975 aa24.37■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 IGSF21Q96ID5 467 aa24.37■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 VN1R3Q9BXE9 311 aa24.37■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 LZTS1Q9Y250 596 aa24.37■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa24.37■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 EFEMP2O95967 443 aa24.36■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 ALDH2P05091 517 aa24.36■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 PRR29P0C7W0 189 aa24.36■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 HARSP12081 509 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 SLC10A6Q3KNW5 377 aa24.36■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 MICALL1Q8N3F8 863 aa24.36■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 ACAP3Q96P50 834 aa24.36■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 ACCSQ96QU6 501 aa24.36■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 MARCH5Q9NX47 278 aa24.36■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 CACNG4Q9UBN1 327 aa24.36■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa24.36■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 XIRP2A4UGR9 3374 aa24.36■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 CITO14578 2027 aa24.36■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 F8W810 466 aa24.35■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 FSCN2O14926 492 aa24.35■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 PPM1AP35813 382 aa24.35■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 TNFSF9P41273 254 aa24.35■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 SNX27Q96L92 541 aa24.35■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 PAAF1Q9BRP4 392 aa24.35■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 FAN1Q9Y2M0 1017 aa24.35■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms