RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220888.9

TRPS1-201, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 5,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-201ENST00000220888 ATPAF2Q8N5M1 289 aa11.16□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP11.16□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 CEP72Q9P209 647 aa11.16□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa11.16□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 AP3B1O00203 1094 aa11.16□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 APOL1O14791 398 aa11.16□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 ATP9BO43861 1147 aa11.16□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 CAPN15O75808 1086 aa11.16□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 DDHD2O94830 711 aa11.16□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 DPEP1P16444 411 aa11.16□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 MTFR1Q15390 333 aa11.16□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa11.16□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 TIPINQ9BVW5 301 aa11.16□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 UNC45AQ9H3U1 944 aa11.16□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa11.16□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 C17orf102A2RUQ5 167 aa11.16□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 TTLL13PA6NNM8 815 aa11.16□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 SNAP23O00161 211 aa11.16□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 ACTR2P61160 394 aa11.16□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 FLOT2Q14254 428 aa11.16□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 C6orf118Q5T5N4 469 aa11.16□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 PPM1NQ8N819 430 aa11.16□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 NUP85Q9BW27 656 aa11.16□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa11.16□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 SYCE1LA8MT33 242 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 PSMD3O43242 534 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 GFAPP14136 432 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 THPOP40225 353 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 PPP3CCP48454 512 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 ADCY2Q08462 1091 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 NEDD1Q8NHV4 660 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 H7C4K7 107 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 NMT2O60551 498 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 SUPT3HO75486 399 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 MED21Q13503 144 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 CHST13Q8NET6 341 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 MYRIPQ8NFW9 859 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 AIFM3Q96NN9 605 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 MFSD1Q9H3U5 465 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 ERAP1Q9NZ08 941 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 NR2E3Q9Y5X4 410 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 CCDC188H7C350 402 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 PSMD14O00487 310 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 TLR2O60603 784 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 NDUFS3O75489 264 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 NR3C2P08235 984 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 EPB42P16452 691 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 CHMP1BQ7LBR1 199 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 MYOZ2Q9NPC6 264 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 NDUFA10O95299 355 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 KCNH2Q12809 1159 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 SLC9A5Q14940 896 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 C10orf120Q5SQS8 335 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 C9orf131Q5VYM1 1079 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 BTN2A2Q8WVV5 523 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 TMEM143Q96AN5 459 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 PHF21AQ96BD5 680 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 PSD3Q9NYI0 1048 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-201ENST00000220888 MAGI2Q86UL8 1455 aa11.15□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 CAV1Q03135 178 aa11.15□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 CDH18Q13634 790 aa11.15□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 LAMC2Q13753 1193 aa11.15□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 SPARCL1Q14515 664 aa11.15□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa11.15□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 CHSY1Q86X52 802 aa11.15□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 ARHGAP18Q8N392 663 aa11.15□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 RABGGTAQ92696 567 aa11.15□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 KLHL29Q96CT2 875 aa11.15□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 ING2Q9H160 280 aa11.15□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 PARVAQ9NVD7 372 aa11.15□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 FBXL21Q9UKT6 434 aa11.15□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa11.15□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 CEP170Q5SW79 1584 aa11.15□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 ZMYND10O75800 440 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 URODP06132 367 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 RFC5P40937 340 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 HS6ST3Q8IZP7 471 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 ZSCAN32Q9NX65 697 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
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