RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000208091.1

Smarca2-231, Transcript of Probable global transcription activator SNF2L2, mouse

TSL 5 BASIC

Gene Smarca2, Length 1,140 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Vmn2r55	G3UWZ4	781 aa		7.53	□□□□□ -1.2
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Vmn2r53	L7N473	806 aa		7.53	□□□□□ -1.2
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Nfatc2ip	O09130	412 aa		7.53	□□□□□ -1.2
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Ldha	P06151	332 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Npr1	P18293	1057 aa		7.53	□□□□□ -1.2
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Lta4h	P24527	611 aa		7.53	□□□□□ -1.2
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Tbca	P48428	108 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Wbp1	P97764	304 aa		7.53	□□□□□ -1.2
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Col6a2	Q02788	1034 aa		7.53	□□□□□ -1.2
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Scg2	Q03517	617 aa		7.53	□□□□□ -1.2
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Lrrfip1	Q3UZ39	729 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Wee2	Q66JT0	555 aa		7.53	□□□□□ -1.2
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Rad9b	Q6WBX7	403 aa		7.53	□□□□□ -1.2
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Nod1	Q8BHB0	953 aa		7.53	□□□□□ -1.2
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Fbxo9	Q8BK06	437 aa		7.53	□□□□□ -1.2
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Nrac	Q8BNX7	165 aa		7.53	□□□□□ -1.2
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Amz1	Q8BVF9	502 aa		7.53	□□□□□ -1.2
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Ppme1	Q8BVQ5	386 aa		7.53	□□□□□ -1.2
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Tdrd7	Q8K1H1	1086 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Wipi1	Q8R3E3	446 aa		7.53	□□□□□ -1.2
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Adam1b	Q8R534	806 aa		7.53	□□□□□ -1.2
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Ccdc71	Q8VEG0	433 aa		7.53	□□□□□ -1.2
Smarca2-231	ENSMUST00000208091		Q922R1	422 aa		7.53	□□□□□ -1.2
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Rtfdc1	Q99K95	307 aa		7.53	□□□□□ -1.2
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Rnf14	Q9JI90	485 aa		7.53	□□□□□ -1.2
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Rai2	Q9QVY8	529 aa		7.53	□□□□□ -1.2
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Hectd1	Q69ZR2	2618 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Prune2	Q52KR3	3084 aa		7.52	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Myh9	Q8VDD5	1960 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	4932429P05Rik	A2ADI4	785 aa		7.52	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Dgki	D3YWQ0	1071 aa		7.52	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Sprtn	G3X912	497 aa		7.52	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Nfil3	O08750	462 aa		7.52	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Rad51b	O35719	350 aa		7.52	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Mllt10	O54826	1068 aa		7.52	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Adcy1	O88444	1118 aa		7.52	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Dbx1	P52950	335 aa		7.52	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Dnajc2	P54103	621 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Traf6	P70196	530 aa		7.52	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Dspp	P97399	934 aa		7.52	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Enah	Q03173	802 aa		7.52	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Rsph3a	Q3UFY4	516 aa		7.52	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Skap2	Q3UND0	358 aa		7.52	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Grhl3	Q5FWH3	603 aa		7.52	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Myl10	Q62082	202 aa		7.52	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Tusc1	Q673H1	205 aa		7.52	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Heatr6	Q6P1G0	1184 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Smarcc2	Q6PDG5	1213 aa		7.52	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Lca5	Q80ST9	704 aa		7.52	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Mettl2	Q8BMK1	389 aa		7.52	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Def6	Q8C2K1	630 aa		7.52	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091		Q8CC96	669 aa		7.52	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Bmp2k	Q91Z96	1138 aa		7.52	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Rsph3b	Q9DA80	389 aa		7.52	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Krt17	Q9QWL7	433 aa		7.52	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Pi4ka	E9Q3L2	2105 aa		7.51	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Wdfy4	E9Q2M9	3149 aa		7.51	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	9630041A04Rik	D3Z3U4	205 aa		7.51	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Usp35	M0QWN7	1009 aa		7.51	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Nrsn1	P97799	196 aa		7.51	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Ly9	Q01965	654 aa		7.51	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	H2-Q2	Q4KN81	360 aa		7.51	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Ssr4	Q62186	172 aa		7.51	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Mcf2l	Q64096	1149 aa		7.51	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Ccdc154	Q6RUT8	657 aa		7.51	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Cspg5	Q71M36	566 aa		7.51	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Cyth4	Q80YW0	393 aa		7.51	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Rnf41	Q8BH75	317 aa		7.51	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Ptk7	Q8BKG3	1062 aa		7.51	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	LRWD1	Q8BUI3	648 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Dym	Q8CHY3	669 aa		7.51	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Rhot2	Q8JZN7	620 aa		7.51	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Tmem30a	Q8VEK0	364 aa		7.51	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Prmt7	Q922X9	692 aa		7.51	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Tas1r3	Q925D8	858 aa		7.51	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Galntl5	Q9D4M9	431 aa		7.51	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Rpap3	Q9D706	660 aa		7.51	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Mlh1	Q9JK91	760 aa		7.51	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Gde1	Q9JL56	331 aa		7.51	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Bcar3	Q9QZK2	820 aa		7.51	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Adam23	Q9R1V7	829 aa		7.51	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Nup210l	Q9D2F7	1881 aa		7.5	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Ccdc78	D3Z5T1	437 aa		7.5	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Tcp10b	E9PYJ0	438 aa		7.5	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Tcp10c	E9Q046	482 aa		7.5	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Ppef2	O35385	757 aa		7.5	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Prnp	P04925	254 aa		7.5	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Wipf3	P0C7L0	485 aa		7.5	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Rab23	P35288	237 aa		7.5	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Prlr	Q08501	608 aa		7.5	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Tubal3	Q3UX10	446 aa		7.5	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Heca	Q3V1N5	544 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Syna	Q5G5D5	617 aa		7.5	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Rtp3	Q5QGU6	474 aa		7.5	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Igf2bp2	Q5SF07	592 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Prdm1	Q60636	856 aa		7.5	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Lrmp	Q60664	539 aa		7.5	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Epha1	Q60750	977 aa		7.5	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Usp17la	Q61068	526 aa		7.5	□□□□□ -1.21
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Bcar1	Q61140	874 aa		7.5	□□□□□ -1.21

Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 39.2 ms