RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Epc2Q8C0I4 808 aa22.57■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fermt3Q8K1B8 665 aa22.57■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tspan8Q8R3G9 235 aa22.57■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 BbxQ8VBW5 907 aa22.57■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Acot11Q8VHQ9 594 aa22.57■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ino80bQ99PT3 375 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PhipQ8VDD9 1821 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ctnnd1P30999 938 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fmr1P35922 614 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 SpopQ6ZWS8 374 aa22.56■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Azin2Q8BVM4 459 aa22.56■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dennd1aQ8K382 1016 aa22.56■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 GzmnQ920S1 248 aa22.56■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Q922C1 641 aa22.56■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pdxdc1Q99K01 787 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccdc91Q9D8L5 442 aa22.56■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 GgcxQ9QYC7 757 aa22.56■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 506 aa22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zscan4-ps2A0A1C7CYU6 506 aa22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 R3hdm1E9Q9Q2 1135 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tbx3P70324 741 aa22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Palb2Q3U0P1 1104 aa22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cnksr2Q80YA9 1032 aa22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nrbp2Q91V36 499 aa22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rpn1Q91YQ5 608 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Usp26Q99MX1 835 aa22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Coro7Q9D2V7 922 aa22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cpne8Q9DC53 577 aa22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Plcg1Q62077 1302 aa22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp457L7N1X4 647 aa22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ifnb1P01575 182 aa22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 LipeP54310 759 aa22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sema5bQ60519 1093 aa22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mkrn3Q60764 544 aa22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ugt1a9Q62452 528 aa22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rnf139Q7TMV1 668 aa22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Erlin2Q8BFZ9 340 aa22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Stoml1Q8CI66 399 aa22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Commd10Q8JZY2 202 aa22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Emc2Q9CRD2 297 aa22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cnot8Q9D8X5 292 aa22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Prmt2Q9R144 448 aa22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Atp8a1P70704 1164 aa22.54■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Col9a2Q07643 688 aa22.54■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam83hQ148V8 1209 aa22.54■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Miga1Q4QQM5 600 aa22.54■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Adad1Q5SUE7 619 aa22.54■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sema5aQ62217 1077 aa22.54■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tsga10Q6NY15 697 aa22.54■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 FtoQ8BGW1 502 aa22.54■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 C130026I21RikQ8C898 291 aa22.54■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Unc5bQ8K1S3 945 aa22.54■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ttc8Q8VD72 515 aa22.54■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pcdha2Q91Y17 948 aa22.54■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Grhl1Q921D9 618 aa22.54■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Psmd6Q99JI4 389 aa22.54■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CalcbQ99MP3 130 aa22.54■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cep19Q9CQA8 163 aa22.54■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Snx24Q9CRB0 169 aa22.54■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Stat2Q9WVL2 923 aa22.54■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ttc13A0A1L1SSC7 844 aa22.53■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn2r15L7N2A0 855 aa22.53■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 P01734 135 aa22.53■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Trim72Q1XH17 477 aa22.53■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kmt5aQ2YDW7 349 aa22.53■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Arl14Q3SXC5 192 aa22.53■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Six1Q62231 284 aa22.53■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Foxo6Q70KY4 559 aa22.53■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sestd1Q80UK0 696 aa22.53■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rab11fip1Q9D620 645 aa22.53■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rpap3Q9D706 660 aa22.53■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 IdeQ9JHR7 1019 aa22.53■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rasgrp1Q9Z1S3 795 aa22.53■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bpifb9bA2AJD1 591 aa22.53■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 SpoplQ2M2N2 392 aa22.53■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccdc25Q78PG9 208 aa22.53■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Supt20hQ7TT00 530 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Prdm4Q80V63 803 aa22.53■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bpifb9aQ80XI7 591 aa22.53■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ndufab1Q9CR21 156 aa22.53■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pdk2Q9JK42 407 aa22.53■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Arih1Q9Z1K5 555 aa22.53■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Arhgef10lA2AWP8 1280 aa22.52■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Wdr72D3YYM4 1114 aa22.52■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Clca3bE9PUL3 1044 aa22.52■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MafbP54841 323 aa22.52■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Atp11aP98197 1187 aa22.52■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ly9Q01965 654 aa22.52■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Wdr41Q3UDP0 460 aa22.52■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Wdr18Q4VBE8 431 aa22.52■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccdc92bQ5SUE3 299 aa22.52■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mybpc2Q5XKE0 1136 aa22.52■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc20a2Q80UP8 656 aa22.52■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gcfc2Q8BKT3 769 aa22.52■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Scrn2Q8VCA8 425 aa22.52■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc12a6Q924N4 1150 aa22.52■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lman1Q9D0F3 517 aa22.52■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nudt12Q9DCN1 462 aa22.52■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dpp7Q9ET22 506 aa22.52■■□□□ 1.2
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Col4a3Q9QZS0 1669 aa22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 16.3 ms