RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C YAL064W-BO13512 126 aa1.21□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C YPR096CO13587 100 aa1.21□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C RPP0P05317 312 aaKnown RBP1.21□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C MET2P08465 486 aa1.21□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C CAM1P29547 415 aaKnown RBP1.21□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C ERG2P32352 222 aa1.21□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C TRM7P38238 310 aaKnown RBP1.21□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C HSH155P49955 971 aaKnown RBP1.21□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C MIG2P53035 382 aa1.21□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C RSM27P53305 110 aa1.21□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C ALG9P53868 555 aaKnown RBP1.21□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C GMC2Q06201 188 aa1.21□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C SEC10Q06245 871 aa1.21□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C ARV1Q06541 321 aa1.21□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C PER33Q12144 273 aa1.21□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C SSK22P25390 1331 aaPredicted RBP1.21□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C MET16P18408 261 aaPredicted RBP1.2□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C MIG1P27705 504 aa1.2□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C PEX3P28795 441 aa1.2□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C ALK2P32789 676 aaPredicted RBP1.2□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C SDH4P37298 181 aa1.2□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C HSM3P38348 480 aa1.2□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C RCY1P39531 840 aa1.2□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C COA1P40452 197 aa1.2□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C SER33P40510 469 aa1.2□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C YGL088WP53151 121 aa1.2□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C SDC1Q03323 175 aa1.2□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C RLP24Q07915 199 aaKnown RBP1.2□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C YPL150WQ12152 901 aa1.2□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C RRP36Q12481 300 aaPredicted RBP1.2□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C YOS9Q99220 542 aa1.2□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C PAN1P32521 1480 aa1.2□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C TDH2P00358 332 aaKnown RBP1.19□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C RPL24AP04449 155 aaKnown RBP1.19□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C KRE1P17260 313 aa1.19□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C SPL2P38839 148 aa1.19□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C SUR2P38992 349 aa1.19□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C YER084WP40057 128 aa1.19□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C TAD2P47058 250 aa1.19□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C KAP114P53067 1004 aa1.19□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C TIM21P53220 239 aa1.19□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C MNT4P53745 580 aa1.19□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C YNL095CP53932 642 aa1.19□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C YPL039WQ03080 316 aa1.19□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C CTR3Q06686 241 aa1.19□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C TIM22Q12328 207 aa1.19□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C RPL4AP10664 362 aaKnown RBP1.19□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C ZWF1P11412 505 aaKnown RBP1.19□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C HMT1P38074 348 aa1.19□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C ARN2P38724 620 aa1.19□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C YHI9P38765 294 aa1.19□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C SHC1P39000 512 aa1.19□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C SCC4P40090 624 aa1.19□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C YJL118WP47022 219 aa1.19□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C OST3P48439 350 aa1.19□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C RPL4BP49626 362 aaKnown RBP1.19□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C OST6Q03723 332 aa1.19□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C COX20Q04935 205 aa1.19□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C FEX1Q08913 375 aa1.19□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C FEX2Q08991 375 aa1.19□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C AI5_BETAQ9ZZX0 354 aa1.19□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C NUP157P40064 1391 aaKnown RBP1.19□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C COX2P00410 251 aa1.18□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C HIS1P00498 297 aaKnown RBP1.18□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C HIS3P06633 220 aa1.18□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C CSG2P35206 410 aa1.18□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C CAB3P36076 571 aa1.18□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C PET100P38958 111 aa1.18□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C NPT1P39683 429 aaKnown RBP1.18□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C NBP35P52920 328 aa1.18□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C MPP6P53725 186 aaPredicted RBP1.18□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C SWS2P53937 143 aa1.18□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C YMR166CQ03829 368 aa1.18□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C YOL019WQ08157 551 aa1.18□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C YBL112CQ3E7Y4 105 aa1.18□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C YEL009C-AA0A023PZF2 135 aa1.17□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C RSA4P25382 515 aaKnown RBP1.17□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C YKR032WP36127 104 aa1.17□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C HEK2P38199 381 aaKnown RBP RIP-Chip data1.17□□□□□ -2.22not detected
HDA3YPR179C YHL049CP38722 271 aa1.17□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C PRM9P39551 298 aa1.17□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C DDI1P40087 428 aa1.17□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C YER188WP40103 239 aa1.17□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C KAP95Q06142 861 aaKnown RBP1.17□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C SME1Q12330 94 aaPredicted RBP1.17□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C ISD11Q6Q560 94 aa1.17□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C STH1P32597 1359 aa1.17□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C COS2P0CX12 379 aa1.17□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C COS3P0CX13 379 aa1.17□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C POL30P15873 258 aaKnown RBP1.17□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C PIR5P46999 287 aa1.17□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C YJR012CP47087 207 aa1.17□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C NBP1P52919 319 aaPredicted RBP1.17□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C MAL13P53338 473 aa1.17□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C ALG11P53954 548 aaKnown RBP1.17□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C ATC1Q04005 294 aa1.17□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C FCF1Q05498 189 aaPredicted RBP1.17□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C CLP1Q08685 445 aaPredicted RBP1.17□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C INO80P53115 1489 aa1.17□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C MRP1P10662 321 aaKnown RBP1.16□□□□□ -2.22
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