RNA–Protein interactions for RNA: YHR195W

NVJ1, Transcript of Nuclear envelope protein, yeast

Gene NVJ1, Length 966 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NVJ1	YHR195W	NAS6	P50086	228 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	MIC26	P50087	233 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	VEL1	P53058	206 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	LST7	P53237	242 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	OKP1	P53298	406 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	CPD1	P53314	239 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	COS6	P53344	381 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	BOR1	P53838	576 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	ABF2	Q02486	183 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	RIF2	Q06208	395 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	MHR1	Q06630	226 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	YPR091C	Q06833	770 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	NSL1	Q12143	216 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	BBP1	Q12365	385 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	DCN1	Q12395	269 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	PET54	P10834	293 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	MSI1	P13712	422 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	URA6	P15700	204 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	CSE2	P33308	149 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	UPS2	P35200	230 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	IST2	P38250	946 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	PAN6	P40459	309 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	SLM1	P40485	686 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	BMT5	P40493	336 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	REE1	P40893	198 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	PRM10	P42946	383 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	YFH7	P43591	353 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	ASG7	P46993	209 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	YJR054W	P47114	497 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	YJR056C	P47115	236 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	MOG1	P47123	218 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	BRR6	P53062	197 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	NUP49	Q02199	472 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	YDR248C	Q03786	193 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	ASR1	Q06834	288 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	HEM25	Q07534	307 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	YOL019W	Q08157	551 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	APC9	Q12107	265 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	FCY22	Q12119	530 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	CDC8	P00572	216 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	DCC1	P25559	380 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	YHR035W	P38769	630 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	EGT2	P42835	1041 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	YGR210C	P42942	411 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	KEG1	P43614	200 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	YJR012C	P47087	207 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	MGA1	P53050	456 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	RMI1	Q02685	241 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	YPL080C	Q02826	108 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	TRM82	Q03774	444 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	CSM3	Q04659	317 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	YPR127W	Q06494	345 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	CTR3	Q06686	241 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	POM33	Q12164	279 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	SFM1	Q12314	213 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	FUN26	P31381	517 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	COS4	P43542	379 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	YFR057W	P43625	151 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	IRC18	P47056	224 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	NIF3	P53081	288 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	MMS2	P53152	137 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	MST27	P53176	234 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	SNO1	Q03144	224 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	MAK3	Q03503	176 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	YMR010W	Q03687	405 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	DXO1	Q06349	442 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	MFG1	Q07684	458 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	RAD50	P12753	1312 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.13	□□□□□ -1.75	not detected
NVJ1	YHR195W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	MGT1	P26188	188 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	MRPL6	P32904	214 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	SGE1	P33335	543 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	TIP20	P33891	701 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	RCK2	P38623	610 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	RCF2	P53721	224 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	SNX41	Q04053	625 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	YNG1	Q08465	219 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	ALE1	Q08548	619 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	YDR018C	Q12185	396 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	YDL199C	Q12407	687 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	IZH2	Q12442	317 aa		4.13	□□□□□ -1.75

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