RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640077.1

MED17-223, Transcript of mediator complex subunit 17, human

TSL 5

Gene MED17, Length 2,210 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MED17-223	ENST00000640077	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	DYNC1I1	O14576	645 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	PRKD3	O94806	890 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	PCDH8	O95206	1070 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	ADAM15	Q13444	863 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	CLEC14A	Q86T13	490 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	CEP152	O94986	1710 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	FSD2	A1L4K1	749 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	GPR42	O15529	346 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	NRP2	O60462	931 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	CELA3B	P08861	270 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	SAMD11	Q96NU1	681 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	PTPN18	Q99952	460 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	ANO3	Q9BYT9	981 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	PRSS50	Q9UI38	385 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	DNAI1	Q9UI46	699 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	STRC	Q7RTU9	1775 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	C2orf78	A6NCI8	922 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	FSBP	O95073	299 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	CR2	P20023	1033 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	ENPP1	P22413	925 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	ADCY7	P51828	1080 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	ERVK-21	P61565	698 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	PLP2	Q04941	152 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	DUSP8	Q13202	625 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	GAGE13	Q4V321	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	DNER	Q8NFT8	737 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	GAB3	Q8WWW8	586 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	RABGGTA	Q92696	567 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	PSMD1	Q99460	953 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	VTA1	Q9NP79	307 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	NUP155	O75694	1391 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077		K7ESM1	405 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	DAPK3	O43293	454 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	ADAM8	P78325	824 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	RAX2	Q96IS3	184 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	MENT	Q9BUN1	341 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	PANK2	Q9BZ23	570 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	EID1	Q9Y6B2	187 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	UNC13B	O14795	1591 aa		4.96	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		4.96	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	NOS1	P29475	1434 aa		4.96	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	PATE3	B3GLJ2	98 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	MTSS1	O43312	755 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	SLC26A4	O43511	780 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	EFEMP1	Q12805	493 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	IDI1	Q13907	227 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	UGT8	Q16880	541 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	CT83	Q5H943	113 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	NELFA	Q9H3P2	528 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	ANKRD62	A6NC57	917 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	UQCRH	P07919	91 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	KCNJ4	P48050	445 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	NRG3	P56975	720 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	PPARA	Q07869	468 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	PTPRO	Q16827	1216 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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