RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 TAF2Q6P1X5 1199 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 MPZL3Q6UWV2 235 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 SH3TC2Q8TF17 1288 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 GRIN2DO15399 1336 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 EPHB6O15197 1021 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM189A1O60320 539 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 SKILP12757 684 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 ACLYP53396 1101 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 EXOC3L4Q17RC7 722 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 CBWD6Q4V339 395 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 CBWD3Q5JTY5 395 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 CBWD5Q5RIA9 395 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 GBP6Q6ZN66 633 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM139Q8IV31 216 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF710Q8N1W2 664 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC112Q8NEF3 446 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 NEK11Q8NG66 645 aa27.07■■□□□ 1.92
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CAPNS1-215ENST00000628018 TCHPQ9BT92 498 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 ESPNB1AK53 854 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 KRT9P35527 623 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 ACOT2P49753 483 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 PPP3CAQ08209 521 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 ZBTB33Q86T24 672 aa27.06■■□□□ 1.92
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CAPNS1-215ENST00000628018 CDHR5Q9HBB8 845 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 ABHD10Q9NUJ1 306 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 PYCARDQ9ULZ3 195 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 MOXD2PA6NHM9 499 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 NOL4O94818 638 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 PON1P27169 355 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM47CQ5HY64 1035 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 EEF1DP3Q658K8 133 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 USP37Q86T82 979 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 PLCB1Q9NQ66 1216 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 OGTO15294 1046 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 PMM2O15305 246 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 P4HA2O15460 535 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 STX10O60499 249 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 TSPAN1O60635 241 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC9A1P19634 815 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 ZBED6P86452 979 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 PSMD6Q15008 389 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC127Q96BQ5 260 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 DNAJC7Q99615 494 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 OSMRQ99650 979 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 GCNT4Q9P109 453 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 NRDCO43847 1150 aa27.04■■□□□ 1.92
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CAPNS1-215ENST00000628018 DARSP14868 501 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 FECHP22830 423 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 CLDN10P78369 228 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 MYL7Q01449 175 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP27.04■■□□□ 1.922e-8■■□□□ 14
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CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF568Q3ZCX4 644 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 SERINC5Q86VE9 423 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 OR8K1Q8NGG5 319 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 GINS2Q9Y248 185 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 ERLIN2O94905 339 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 MSNP26038 577 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 GTF2H1P32780 548 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 GCLMP48507 274 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 ITGA7Q13683 1181 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM117Q9H0C3 514 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 CDT1Q9H211 546 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 GANQ9H2C0 597 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 PDZD7Q9H5P4 517 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 CEP72Q9P209 647 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 APBA1Q02410 837 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 SEZ6Q53EL9 994 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 ARRDC4Q8NCT1 418 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 KIAA1524Q8TCG1 905 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 CPB2Q96IY4 423 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 UNC93B1Q9H1C4 597 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 SIX2Q9NPC8 291 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1B0GUA9 196 aa27.01■■□□□ 1.91
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