RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP9.31□□□□□ -0.92
SGMS1-211ENST00000626236 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP9.31□□□□□ -0.92
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SGMS1-211ENST00000626236 ZNF568Q3ZCX4 644 aa9.31□□□□□ -0.92
SGMS1-211ENST00000626236 EEF1DP3Q658K8 133 aa9.31□□□□□ -0.92
SGMS1-211ENST00000626236 ANKRD40Q6AI12 368 aa9.31□□□□□ -0.92
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SGMS1-211ENST00000626236 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
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SGMS1-211ENST00000626236 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
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SGMS1-211ENST00000626236 HAPLN2Q9GZV7 340 aa9.3□□□□□ -0.92
SGMS1-211ENST00000626236 CDT1Q9H211 546 aa9.3□□□□□ -0.92
SGMS1-211ENST00000626236 TSPY26PQ9H489 355 aa9.3□□□□□ -0.92
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SGMS1-211ENST00000626236 HSPBP1Q9NZL4 362 aa9.3□□□□□ -0.92
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SGMS1-211ENST00000626236 PTPRSQ13332 1948 aa9.3□□□□□ -0.92
SGMS1-211ENST00000626236 ANK1P16157 1881 aa9.3□□□□□ -0.92
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SGMS1-211ENST00000626236 GOLGA8JA6NMD2 632 aa9.29□□□□□ -0.92
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SGMS1-211ENST00000626236 ADAM9Q13443 819 aa9.29□□□□□ -0.92
SGMS1-211ENST00000626236 IKBKEQ14164 716 aa9.29□□□□□ -0.92
SGMS1-211ENST00000626236 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
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SGMS1-211ENST00000626236 SEZ6Q53EL9 994 aa9.29□□□□□ -0.92
SGMS1-211ENST00000626236 TTI2Q6NXR4 508 aa9.29□□□□□ -0.92
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SGMS1-211ENST00000626236 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa9.29□□□□□ -0.92
SGMS1-211ENST00000626236 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa9.29□□□□□ -0.92
SGMS1-211ENST00000626236 LINC01599Q8WXQ3 324 aa9.29□□□□□ -0.92
SGMS1-211ENST00000626236 VWCEQ96DN2 955 aa9.29□□□□□ -0.92
SGMS1-211ENST00000626236 EEF2KMTQ96G04 330 aa9.29□□□□□ -0.92
SGMS1-211ENST00000626236 MED15Q96RN5 788 aa9.29□□□□□ -0.92
SGMS1-211ENST00000626236 FAM213AQ9BRX8 229 aa9.29□□□□□ -0.92
SGMS1-211ENST00000626236 APOL6Q9BWW8 343 aa9.29□□□□□ -0.92
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