RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617904.4

TRAPPC3-210, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,305 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-210ENST00000617904 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
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TRAPPC3-210ENST00000617904 CAPSQ13938 189 aa18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 ARID5BQ14865 1188 aa18.24■□□□□ 0.51
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TRAPPC3-210ENST00000617904 SCLT1Q96NL6 688 aa18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 TOX2Q96NM4 488 aa18.24■□□□□ 0.51
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TRAPPC3-210ENST00000617904 KCND1Q9NSA2 647 aa18.24■□□□□ 0.51
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TRAPPC3-210ENST00000617904 CASP4P49662 377 aa18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 RNF149Q8NC42 400 aa18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 TMC2Q8TDI7 906 aa18.23■□□□□ 0.51
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TRAPPC3-210ENST00000617904 GRIK4Q16099 956 aa18.23■□□□□ 0.51
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TRAPPC3-210ENST00000617904 RDH13Q8NBN7 331 aa18.23■□□□□ 0.51
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TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC35C1Q96A29 364 aa18.23■□□□□ 0.51
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TRAPPC3-210ENST00000617904 SPAG5Q96R06 1193 aa18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
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TRAPPC3-210ENST00000617904 RNPEPQ9H4A4 650 aa18.23■□□□□ 0.51
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TRAPPC3-210ENST00000617904 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
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TRAPPC3-210ENST00000617904 KRT83P78385 493 aa18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 CDK17Q00537 523 aa18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 FPGSQ05932 587 aa18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 PTPN21Q16825 1174 aa18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
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TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF410Q86VK4 478 aa18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 LRRC71Q8N4P6 559 aa18.22■□□□□ 0.51
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TRAPPC3-210ENST00000617904 NLRP4Q96MN2 994 aa18.22■□□□□ 0.51
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TRAPPC3-210ENST00000617904 CBWD1Q9BRT8 395 aa18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 DEF6Q9H4E7 631 aa18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 SPTLC3Q9NUV7 552 aa18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 GCNT4Q9P109 453 aa18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 FBXL5Q9UKA1 691 aa18.22■□□□□ 0.51
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TRAPPC3-210ENST00000617904 TOM1L1O75674 476 aa18.21■□□□□ 0.51
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TRAPPC3-210ENST00000617904 FECHP22830 423 aa18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 AP3M2P53677 418 aa18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 NKX3-2P78367 333 aa18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 MFSD10Q14728 455 aa18.21■□□□□ 0.51
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TRAPPC3-210ENST00000617904 KIAA0753Q2KHM9 967 aa18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 SFMBT2Q5VUG0 894 aa18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 PRIMPOLQ96LW4 560 aa18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 GLT1D1Q96MS3 346 aa18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 MSTO1Q9BUK6 570 aa18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 TBX21Q9UL17 535 aa18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
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