RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616449.1

ACSS3-208, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 3, human

Gene ACSS3, Length 3,833 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACSS3-208	ENST00000616449	PJA2	O43164	708 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ACSS3-208	ENST00000616449	SHBG	P04278	402 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ACSS3-208	ENST00000616449	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ACSS3-208	ENST00000616449	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
ACSS3-208	ENST00000616449	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
ACSS3-208	ENST00000616449	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ACSS3-208	ENST00000616449	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
ACSS3-208	ENST00000616449	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
ACSS3-208	ENST00000616449	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ACSS3-208	ENST00000616449	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ACSS3-208	ENST00000616449	PARP2	Q9UGN5	583 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ACSS3-208	ENST00000616449	GOLGA8R	I6L899	631 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ACSS3-208	ENST00000616449	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
ACSS3-208	ENST00000616449	POLD1	P28340	1107 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ACSS3-208	ENST00000616449	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	13.65	□□□□□ -0.22
ACSS3-208	ENST00000616449	PPAT	Q06203	517 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ACSS3-208	ENST00000616449	ICE2	Q659A1	982 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ACSS3-208	ENST00000616449	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
ACSS3-208	ENST00000616449	CD248	Q9HCU0	757 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ACSS3-208	ENST00000616449	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ACSS3-208	ENST00000616449	LRP6	O75581	1613 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	MAP3K6	O95382	1288 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	TMEM253	P0C7T8	217 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	MXRA7	P84157	204 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	CCDC6	Q16204	474 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	HVCN1	Q96D96	273 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	FEM1B	Q9UK73	627 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	PEX10	O60683	326 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	BRAF	P15056	766 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF844	Q08AG5	666 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	BBS9	Q3SYG4	887 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	RAPGEF5	Q92565	580 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	ALG3	Q92685	438 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	TJP1	Q07157	1748 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	EXOC1L	A0A1B0GW35	172 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	PYGM	P11217	842 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	KRT10	P13645	584 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	FECH	P22830	423 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	MAP2K2	P36507	400 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	SETDB1	Q15047	1291 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	CRY2	Q49AN0	593 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	PSMC5	P62195	406 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	IRX4	P78413	519 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	APOL6	Q9BWW8	343 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	PLS3	P13797	630 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	TKFC	Q3LXA3	575 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	KLHL29	Q96CT2	875 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	SNHG28	P0DPA3	235 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	CASC4	Q6P4E1	433 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	TRIM7	Q9C029	511 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	SLIT2	O94813	1529 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	RTN2	O75298	545 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	CA4	P22748	312 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	RRM1	P23921	792 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	GNA15	P30679	374 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	PPP2R5E	Q16537	467 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	PALM2	Q8IXS6	379 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	MIF4GD	A9UHW6	222 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23

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