RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607561.1

RNU6-87P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 87, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-87P, Length 108 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-87P-201ENST00000607561 ACO1P21399 889 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 ECHS1P30084 290 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 CRHR1P34998 444 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 GZMKP49863 264 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 RAB27AP51159 221 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 MFSD14BQ5SR56 506 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 TMEM240Q5SV17 173 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZNF585AQ6P3V2 769 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 PQLC1Q8N2U9 271 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 ARL8AQ96BM9 186 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 IL17RAQ96F46 866 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 CEP95Q96GE4 821 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 DEF6Q9H4E7 631 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 TCF7L1Q9HCS4 588 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 IP6K2Q9UHH9 426 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 ATRNL1Q5VV63 1379 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 CCDC154A6NI56 674 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 PLSCR1O15162 318 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 ADKP55263 362 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 CSRP2Q16527 193 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 ODR4Q5SWX8 454 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 ANKS6Q68DC2 871 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 SGMS1Q86VZ5 419 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 STON2Q8WXE9 905 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 EDAQ92838 391 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 KLC2Q9H0B6 622 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 KCNH6Q9H252 994 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 LDAHQ9H6V9 325 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 FAM171A2A8MVW0 826 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 ENDOD1O94919 500 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 AMY1AP04745 511 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 PTPN7P35236 360 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 SLC16A1P53985 500 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 EPHB1P54762 984 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 PER3P56645 1201 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 ADAM17P78536 824 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 IL10RAQ13651 578 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 CDSNQ15517 529 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 C3orf36Q3SXR2 165 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 HS1BP3Q53T59 392 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 FAM47AQ5JRC9 791 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 MFSD5Q6N075 450 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 XYLT1Q86Y38 959 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 MDGA1Q8NFP4 955 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 HSPBAP1Q96EW2 488 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 ADOQ96SZ5 270 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 C7orf25Q9BPX7 421 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 PDCD2LQ9BRP1 358 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 EPC1Q9H2F5 836 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 TCAF1Q9Y4C2 921 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 CAPN14A8MX76 684 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 B8ZZF3 427 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 MFAP3LO75121 409 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 IL33O95760 270 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 S100BP04271 92 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZNF20P17024 532 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 GUCY1A2P33402 732 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 SELENOPP49908 381 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 UAP1L1Q3KQV9 507 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 SPATS1Q496A3 300 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 C1QL3Q5VWW1 255 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 SLC35B2Q8TB61 432 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 CCHCR1Q8TD31 782 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 ST8SIA2Q92186 375 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 MIEF2Q96C03 454 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 FAM89AQ96GI7 184 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 GIT1Q9Y2X7 761 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-87P-201ENST00000607561 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa4.67□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms