RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	KRBA1	A5PL33	1030 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	ASAP2	O43150	1006 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	SLITRK3	O94933	977 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	PAPLN	O95428	1278 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	CFH	P08603	1231 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	TPH2	Q8IWU9	490 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	CNNM3	Q8NE01	707 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	RABGGTA	Q92696	567 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC51	Q96ER9	411 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	CSRNP2	Q9H175	543 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	CHST7	Q9NS84	486 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	FANCM	Q8IYD8	2048 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	TGM5	O43548	720 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	PFKFB2	O60825	505 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	CDKL5	O76039	1030 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	GLRA2	P23416	452 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	AKAP5	P24588	427 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	AXL	P30530	894 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	ARL2	P36404	184 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	ANGPT1	Q15389	498 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	FUT10	Q6P4F1	479 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	PALB2	Q86YC2	1186 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		13.27	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A087WWV3	80 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	MARCH6	O60337	910 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	LYPLA2	O95372	231 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	NPTXR	O95502	500 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	KLK14	Q9P0G3	267 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	CA14	Q9ULX7	337 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	PATJ	Q8NI35	1801 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	DGAT1	O75907	488 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	LARGE1	O95461	756 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	XBP1	P17861	261 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	RARRES1	P49788	294 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	POU5F1B	Q06416	359 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	GRIK3	Q13003	919 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	TFDP1	Q14186	410 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	TRIP11	Q15643	1979 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	RTP2	Q5QGT7	225 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	LILRA6	Q6PI73	481 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	ADSSL1	Q8N142	457 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	GPR152	Q8TDT2	470 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	STAM	Q92783	540 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	NOTCH4	Q99466	2003 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	WNT16	Q9UBV4	365 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A1B0GUA9	196 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	POTEM	A6NI47	508 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	SRF	P11831	508 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	KRT2	P35908	639 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	HTR4	Q13639	388 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	CALCRL	Q16602	461 aa		13.25	□□□□□ -0.29

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms