RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 C22orf31O95567 290 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 GATMP50440 423 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 EMC2Q15006 297 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 MTHFD1LQ6UB35 978 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 MTRQ99707 1265 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 LRFN2Q9ULH4 789 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 KRT18P05783 430 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 TMOD1P28289 359 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 DNM2P50570 870 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 IGBP1P78318 339 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 DRC1Q96MC2 740 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 NECTIN4Q96NY8 510 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 RUSC1Q9BVN2 902 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 TRIM9Q9C026 710 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 SMOC2Q9H3U7 446 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 CLSTN2Q9H4D0 955 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 MYMKA6NI61 221 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 C2CD4DB7Z1M9 353 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 KLRC1P26715 233 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 POSTNQ15063 836 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 ARSHQ5FYA8 562 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 MARCH8Q5T0T0 291 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 IER5Q5VY09 327 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF710Q8N1W2 664 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 DDX12PQ92771 950 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 KIFAP3Q92845 792 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 NUP62CLQ9H1M0 184 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 KCNG1Q9UIX4 513 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 PADI3Q9ULW8 664 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 AFMP43652 599 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 THNSL1Q8IYQ7 743 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 LINC01465Q8N7H1 131 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 SH2D3AQ9BRG2 576 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 CEP250Q9BV73 2442 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 SEMA4AQ9H3S1 761 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 C17orf75Q9HAS0 396 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 LZTS1Q9Y250 596 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 TBCAO75347 108 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 CDC42EP1Q00587 391 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP26■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 CES5AQ6NT32 575 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 LLGL2Q6P1M3 1020 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 ADAM7Q9H2U9 754 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 POMKQ9H5K3 350 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 ACACBO00763 2458 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 SMC2O95347 1197 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 GAP43P17677 238 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 ITIH3Q06033 890 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 GIT2Q14161 759 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 ANGPT1Q15389 498 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 EFCAB12Q6NXP0 572 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC65Q8IXS2 484 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC105Q8IYK2 499 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 DNAJC19Q96DA6 116 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 MAP7D2Q96T17 732 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 REEP2Q9BRK0 252 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 SEL1LQ9UBV2 794 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 ASAP2O43150 1006 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 LMNAP02545 664 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 AOC1P19801 751 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF131P52739 623 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 ASIC1P78348 528 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 DPYDQ12882 1025 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 PAK2Q13177 524 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC183Q5T5S1 534 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 PLPP4Q5VZY2 271 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 UNC13DQ70J99 1090 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 NME8Q8N427 588 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 METTL13Q8N6R0 699 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 FLCNQ8NFG4 579 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 STAMQ92783 540 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 CDH22Q9UJ99 828 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 FRMD3A2A2Y4 597 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 TRAK2O60296 914 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 HIP1RO75146 1068 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM13AO94988 1023 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 ASGR2P07307 311 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 ARL2P36404 184 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 SARSP49591 514 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 CUL4BQ13620 913 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 PPP2R5AQ15172 486 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM102BQ5T8I3 360 aa25.97■■□□□ 1.75
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