RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 CYP2C19P33261 490 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 CCZ1BP86790 482 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 CYP4F11Q9HBI6 524 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 PREX2Q70Z35 1606 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 ORC4O43929 436 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 ARSEP51690 589 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 GCNAQ96QF7 691 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 A0A1B0GTH6 734 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 USP11P51784 963 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 BCAR1P56945 870 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 ANO5Q75V66 913 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 PLA2R1Q13018 1463 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 SYCE1LA8MT33 242 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 BATF3Q9NR55 127 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP22.61■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 IMPG1Q17R60 797 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 RFX8Q6ZV50 586 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 TTLL6Q8N841 843 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 GRAMD1AQ96CP6 724 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 KIF2CQ99661 725 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 C2orf40Q9H1Z8 148 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 RNF146Q9NTX7 359 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 TRIM66O15016 1216 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 RTN2O75298 545 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 NME3Q13232 169 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 FBXO40Q9UH90 709 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 NRKQ7Z2Y5 1582 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 MMP10P09238 476 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 ADORA2BP29275 332 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 SCN4BQ8IWT1 228 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 HPS3Q969F9 1004 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 KRT33BQ14525 404 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 FBXW10Q5XX13 1052 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 LRRC31Q6UY01 552 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 CHP1Q99653 195 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 CYP26A1O43174 497 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 NARFQ9UHQ1 456 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 PNMA3Q9UL41 463 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 STAP1Q9ULZ2 295 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 SNX5Q9Y5X3 404 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 ZHX2Q9Y6X8 837 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 F5H6K3 240 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 KLRC3Q07444 240 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 SCARF1Q14162 830 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 ICA1LQ8NDH6 482 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 MAGEB5Q9BZ81 275 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 ANKMY2Q8IV38 441 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 ARL8AQ96BM9 186 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 SLC10A4Q96EP9 437 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM247A6NEH6 219 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 RAPGEF5Q92565 580 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 MAP3K7CLP57077 242 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 TSPY1Q01534 308 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 SLC26A7Q8TE54 656 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 MDH1P40925 334 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 KCNA1Q09470 495 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 DPYDQ12882 1025 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 EFHC2Q5JST6 749 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 LZTS1Q9Y250 596 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 MED14O60244 1454 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 TCP11X1B4DZS4 312 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC22O60826 627 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC159P0C7I6 412 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 CYFIP1Q7L576 1253 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 TEX2Q8IWB9 1127 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 PDXKO00764 312 aa22.58■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 EYA4O95677 639 aa22.58■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 ESRRBO95718 433 aa22.58■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 NMT1P30419 496 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 TAP1Q03518 808 aa22.58■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa22.58■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 SPATA21Q7Z572 469 aa22.58■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 EPN3Q9H201 632 aa22.58■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 STAT4Q14765 748 aa22.58■■□□□ 1.2
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