RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579531.5

MSI2-211, Transcript of musashi RNA binding protein 2, human

TSL 2

Gene MSI2, Length 472 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSI2-211	ENST00000579531	DGKD	Q16760	1214 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-211	ENST00000579531	MUM1	Q2TAK8	710 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-211	ENST00000579531	KANK2	Q63ZY3	851 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-211	ENST00000579531	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-211	ENST00000579531	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-211	ENST00000579531	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-211	ENST00000579531	KCNK18	Q7Z418	384 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-211	ENST00000579531	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-211	ENST00000579531	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-211	ENST00000579531	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-211	ENST00000579531		Q8N3U1	123 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-211	ENST00000579531	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-211	ENST00000579531	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-211	ENST00000579531	FATE1	Q969F0	183 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-211	ENST00000579531	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-211	ENST00000579531	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-211	ENST00000579531	PSMD1	Q99460	953 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-211	ENST00000579531	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-211	ENST00000579531	ANO3	Q9BYT9	981 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-211	ENST00000579531	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-211	ENST00000579531	MTG2	Q9H4K7	406 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-211	ENST00000579531	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-211	ENST00000579531	KCND1	Q9NSA2	647 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-211	ENST00000579531	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-211	ENST00000579531	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-211	ENST00000579531	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-211	ENST00000579531	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-211	ENST00000579531	SLIT2	O94813	1529 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-211	ENST00000579531	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-211	ENST00000579531	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-211	ENST00000579531	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531		H0Y858	1186 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	ATF2	P15336	505 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	RGS3	P49796	1198 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	DLG4	P78352	724 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	ADAM9	Q13443	819 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	ACAP2	Q15057	778 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	TEKT5	Q96M29	485 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62	4e-16	■■■■□ 21.7
MSI2-211	ENST00000579531	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	PRSS50	Q9UI38	385 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	VWA7	Q9Y334	891 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	IRAK3	Q9Y616	596 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	PEAK1	Q9H792	1746 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	CACNA1F	O60840	1977 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	INSR	P06213	1382 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	RFXAP	O00287	272 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	ERC2	O15083	957 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	FYB1	O15117	783 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	PRC1	O43663	620 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	DTNB	O60941	627 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	IL33	O95760	270 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	MED14OS	P0DP75	135 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	HSPA1L	P34931	641 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	LGALS4	P56470	323 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	IL13RA1	P78552	427 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	CT83	Q5H943	113 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	TOR2A	Q5JU69	321 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	MIER2	Q8N344	545 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	GAB3	Q8WWW8	586 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	KCNN1	Q92952	543 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	LPP	Q93052	612 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	FAM84A	Q96KN4	292 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms