RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF569Q5MCW4 686 aa31.57■■■□□ 2.64
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CTDNEP1-208ENST00000573600 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP31.57■■■□□ 2.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 HAPLN2Q9GZV7 340 aa31.57■■■□□ 2.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 L2HGDHQ9H9P8 463 aa31.57■■■□□ 2.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa31.57■■■□□ 2.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 GUCA1BQ9UMX6 200 aa31.57■■■□□ 2.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 CLDN3O15551 220 aa31.56■■■□□ 2.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 CYP2C19P33261 490 aa31.56■■■□□ 2.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 SOX5P35711 763 aa31.56■■■□□ 2.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 PTENP60484 403 aa31.56■■■□□ 2.64
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CTDNEP1-208ENST00000573600 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa31.56■■■□□ 2.64
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CTDNEP1-208ENST00000573600 Q9Y3F1 56 aa31.56■■■□□ 2.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 F8VZ95 297 aa31.55■■■□□ 2.64
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CTDNEP1-208ENST00000573600 MAGEA1P43355 309 aa31.55■■■□□ 2.64
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC18A3Q16572 532 aa31.55■■■□□ 2.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 MTHFD1LQ6UB35 978 aa31.55■■■□□ 2.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP31.55■■■□□ 2.64
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CTDNEP1-208ENST00000573600 FZD8Q9H461 694 aa31.55■■■□□ 2.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 FANCGO15287 622 aa31.55■■■□□ 2.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 ABL1P00519 1130 aa31.55■■■□□ 2.64
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CTDNEP1-208ENST00000573600 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP31.55■■■□□ 2.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 TLK2Q86UE8 772 aa31.55■■■□□ 2.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 FBXL13Q8NEE6 735 aa31.55■■■□□ 2.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZIC5Q96T25 663 aa31.55■■■□□ 2.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 ACKR2O00590 384 aa31.54■■■□□ 2.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 PHKA2P46019 1235 aa31.54■■■□□ 2.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 GPC3P51654 580 aa31.54■■■□□ 2.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 GRIK4Q16099 956 aa31.54■■■□□ 2.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 KAT6AQ92794 2004 aa31.54■■■□□ 2.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP31.54■■■□□ 2.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 RRN3P2A6NIE6 340 aa31.53■■■□□ 2.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 ACOT2P49753 483 aa31.53■■■□□ 2.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 FCGRTP55899 365 aa31.53■■■□□ 2.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 PTK2Q05397 1052 aa31.53■■■□□ 2.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 VPS36Q86VN1 386 aa31.53■■■□□ 2.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP31.53■■■□□ 2.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP31.53■■■□□ 2.64
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CTDNEP1-208ENST00000573600 C10orf76Q5T2E6 689 aa31.52■■■□□ 2.64
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC35F6Q8N357 371 aa31.52■■■□□ 2.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 LACRTQ9GZZ8 138 aa31.52■■■□□ 2.64
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CTDNEP1-208ENST00000573600 GJB1P08034 283 aa31.52■■■□□ 2.64
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CTDNEP1-208ENST00000573600 CYP4F22Q6NT55 531 aa31.52■■■□□ 2.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa31.52■■■□□ 2.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZBTB10Q96DT7 871 aa31.52■■■□□ 2.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 TCHPQ9BT92 498 aa31.52■■■□□ 2.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP31.52■■■□□ 2.64
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CTDNEP1-208ENST00000573600 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP31.52■■■□□ 2.64
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CTDNEP1-208ENST00000573600 EVI5O60447 810 aa31.51■■■□□ 2.63
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CTDNEP1-208ENST00000573600 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP31.5■■■□□ 2.63
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CTDNEP1-208ENST00000573600 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa31.5■■■□□ 2.63
CTDNEP1-208ENST00000573600 ARHGEF19Q8IW93 802 aa31.5■■■□□ 2.63
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CTDNEP1-208ENST00000573600 OGTO15294 1046 aa31.49■■■□□ 2.63
CTDNEP1-208ENST00000573600 TNNI1P19237 187 aa31.49■■■□□ 2.63
CTDNEP1-208ENST00000573600 PROZP22891 400 aa31.49■■■□□ 2.63
CTDNEP1-208ENST00000573600 CTGFP29279 349 aa31.49■■■□□ 2.63
CTDNEP1-208ENST00000573600 MPZL3Q6UWV2 235 aa31.49■■■□□ 2.63
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