RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566915.5

LPCAT2-208, Transcript of lysophosphatidylcholine acyltransferase 2, human

TSL 1 (best)

Gene LPCAT2, Length 5,285 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LPCAT2-208	ENST00000566915	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	AP1B1	Q10567	949 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	TCP10	Q12799	353 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	LAMB3	Q13751	1172 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	EPHA7	Q15375	998 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	MAML1	Q92585	1016 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	SERPINB12	Q96P63	405 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	CALN1	Q9BXU9	219 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	PARVA	Q9NVD7	372 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	ASNS	P08243	561 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	GHR	P10912	638 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	SLC20A2	Q08357	652 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	GDAP1	Q8TB36	358 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	KRT35	Q92764	455 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	FAF2	Q96CS3	445 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	AGPAT1	Q99943	283 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	GINM1	Q9NU53	330 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	TBK1	Q9UHD2	729 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	GGA2	Q9UJY4	613 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	FEM1B	Q9UK73	627 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915		A0A0G2JND7	137 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	KRT14	P02533	472 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	CIITA	P33076	1130 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	SERPINB10	P48595	397 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	HIC1	Q14526	733 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	UGP2	Q16851	508 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	SUSD4	Q5VX71	490 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	SFR1	Q86XK3	245 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	DNAJC7	Q99615	494 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	GSTA4	O15217	222 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	LPXN	O60711	386 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	RAD17	O75943	681 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	GFAP	P14136	432 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	RAD23B	P54727	409 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	KCTD2	Q14681	263 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	MORF4L2	Q15014	288 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	PTGIS	Q16647	500 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	DOK7	Q18PE1	504 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	LZIC	Q8WZA0	190 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	CAVIN3	Q969G5	261 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	ZBTB9	Q96C00	473 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	NUP85	Q9BW27	656 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	FUT8	Q9BYC5	575 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	BFAR	Q9NZS9	450 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	RAB21	Q9UL25	225 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	L1RE1	Q9UN81	338 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	GLTPD2	A6NH11	291 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	PIK3R2	O00459	728 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	SRGAP2	O75044	1071 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	ESRRB	O95718	433 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	PRR29	P0C7W0	189 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67

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