RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564966.5

PPP4C-208, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 2

Gene PPP4C, Length 1,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-208	ENST00000564966	RAB34	Q9BZG1	259 aa		28.02	■■■□□ 2.08
PPP4C-208	ENST00000564966	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		28.02	■■■□□ 2.08
PPP4C-208	ENST00000564966	KIF3A	Q9Y496	699 aa		28.02	■■■□□ 2.08
PPP4C-208	ENST00000564966	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	28.01	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	ST18	O60284	1047 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	PRKCB	P05771	671 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	CYP11B2	P19099	503 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	GLUD2	P49448	558 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	PPP2R5A	Q15172	486 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	MAPK6	Q16659	721 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	IFT74	Q96LB3	600 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	POLD4	Q9HCU8	107 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966		F8W810	466 aa		28	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	N4BP3	O15049	544 aa		28	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	INPPL1	O15357	1258 aa		28	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	28	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	CLCN4	P51793	760 aa		28	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	DSC1	Q08554	894 aa		28	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		28	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	RABEP1	Q15276	862 aa		28	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	28	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		28	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	28	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	BSND	Q8WZ55	320 aa		28	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	RABGGTA	Q92696	567 aa		28	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		28	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	ADH1A	P07327	375 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	MYB	P10242	640 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	GRIK3	Q13003	919 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	PTGDR	Q13258	359 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	FZD8	Q9H461	694 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	27.99	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	27.99	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	TECTA	O75443	2155 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	MUT	P22033	750 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	27.98	■■■□□ 2.07	5e-8	■■■□□ 19.2
PPP4C-208	ENST00000564966	NAMPT	P43490	491 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	ECM1	Q16610	540 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	USP20	Q9Y2K6	914 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	STK24	Q9Y6E0	443 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	TRIO	O75962	3097 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	TADA2A	O75478	443 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	27.97	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	FAM187B	Q17R55	369 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	KRT79	Q5XKE5	535 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	B3GALT6	Q96L58	329 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	SNTG2	Q9NY99	539 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	TEX28	O15482	410 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	LILRB3	O75022	631 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	GLUD1	P00367	558 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	MTMR3	Q13615	1198 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	PDIA5	Q14554	519 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	FUT10	Q6P4F1	479 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	KIFAP3	Q92845	792 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	DPP7	Q9UHL4	492 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PPP4C-208	ENST00000564966		H3BQV1	296 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	ACKR2	O00590	384 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	27.95	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	USP41	Q3LFD5	358 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	GPR149	Q86SP6	731 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	27.95	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	DNM3	Q9UQ16	869 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	GDA	Q9Y2T3	454 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		27.94	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	CCDC169	A6NNP5	214 aa		27.94	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	PP2D1	A8MPX8	630 aa		27.94	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	EFNA5	P52803	228 aa		27.94	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		27.94	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		27.94	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	PALB2	Q86YC2	1186 aa		27.94	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	FBXL6	Q8N531	539 aa		27.94	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	HASPIN	Q8TF76	798 aa		27.94	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	27.94	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		27.94	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	KCNH6	Q9H252	994 aa		27.94	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966		E9PMD0	336 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	LAD1	O00515	517 aa		27.93	■■■□□ 2.06

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