RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547298.5

CS-208, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-208ENST00000547298 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 COL4A2P08572 1712 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 TMEM150BA6NC51 233 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 CYP3A4P08684 503 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 FCARP24071 287 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 HOXA9P31269 272 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 ZNF76P36508 570 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 CDC42EP1Q00587 391 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 PTH1RQ03431 593 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 PPP2R5DQ14738 602 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 WDR44Q5JSH3 913 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 PLA2G2CQ5R387 149 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 FUT10Q6P4F1 479 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 CATSPER4Q7RTX7 472 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 ZNF410Q86VK4 478 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 LONP2Q86WA8 852 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 ING5Q8WYH8 240 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 DNASE1L2Q92874 299 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 ADAM33Q9BZ11 813 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 LNPKQ9C0E8 428 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 RNF39Q9H2S5 420 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 OSBPL3Q9H4L5 887 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 KCNH3Q9ULD8 1083 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 TMEM8BA6NDV4 472 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 ARL5CA6NH57 179 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 MAN2B1O00754 1011 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 AXIN1O15169 862 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 ADAM12O43184 909 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 C8AP07357 584 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 POU2F2P09086 479 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 AP3B2Q13367 1082 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 SLC5A9Q2M3M2 681 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 USP41Q3LFD5 358 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 RTP2Q5QGT7 225 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 PPM1LQ5SGD2 360 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 TMTC3Q6ZXV5 915 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 TEX2Q8IWB9 1127 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 GSTCDQ8NEC7 633 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 FAM3CQ92520 227 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 LENG9Q96B70 501 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 MCRS1Q96EZ8 462 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 GAD1Q99259 594 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 SH2D3AQ9BRG2 576 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 MINDY3Q9H8M7 445 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 GREB1Q4ZG55 1949 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 CEP295Q9C0D2 2601 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 WDR81Q562E7 1941 aa12.67□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 HIP1O00291 1037 aa12.67□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 EDIL3O43854 480 aa12.67□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 MLH1P40692 756 aa12.67□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 ADCY7P51828 1080 aa12.67□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 NAPAP54920 295 aa12.67□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 FOXC1Q12948 553 aa12.67□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 GRM2Q14416 872 aa12.67□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 RHPN2Q8IUC4 686 aa12.67□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 MAP4K3Q8IVH8 894 aa12.67□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 SPEM1Q8N4L4 309 aa12.67□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 RABGGTAQ92696 567 aa12.67□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 ELSPBP1Q96BH3 223 aa12.67□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 ZFP42Q96MM3 310 aa12.67□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 SMOC1Q9H4F8 434 aa12.67□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 DISC1Q9NRI5 854 aa12.67□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 F5P12259 2224 aa12.67□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 SMCO2A6NFE2 343 aa12.66□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 WDR64B1ANS9 1081 aa12.66□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 EPN2O95208 641 aa12.66□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 RAP1GAPP47736 663 aa12.66□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 SCNN1GP51170 649 aa12.66□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 FUT2Q10981 343 aa12.66□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 PTGDRQ13258 359 aa12.66□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 MTERF2Q49AM1 385 aa12.66□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 NLRP4Q96MN2 994 aa12.66□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 COLEC11Q9BWP8 271 aa12.66□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 CACNG4Q9UBN1 327 aa12.66□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 ADAM28Q9UKQ2 775 aa12.66□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 POLIQ9UNA4 740 aa12.66□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 SAMM50Q9Y512 469 aa12.66□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 IPPQ9Y573 584 aa12.66□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 IGF2RP11717 2491 aa12.66□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-208ENST00000547298 LOC400499M0QZD8 3231 aa12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 6.4 ms