RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546023.1

TCP1-217, Transcript of t-complex 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TCP1, Length 1,135 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1-217ENST00000546023 ERVFC1P60507 584 aa27.89■■■□□ 2.06
TCP1-217ENST00000546023 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
TCP1-217ENST00000546023 PLPP4Q5VZY2 271 aa27.89■■■□□ 2.06
TCP1-217ENST00000546023 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
TCP1-217ENST00000546023 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
TCP1-217ENST00000546023 TAS1R3Q7RTX0 852 aa27.89■■■□□ 2.06
TCP1-217ENST00000546023 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
TCP1-217ENST00000546023 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
TCP1-217ENST00000546023 RPS6KC1Q96S38 1066 aa27.89■■■□□ 2.06
TCP1-217ENST00000546023 TMEM175Q9BSA9 504 aa27.89■■■□□ 2.06
TCP1-217ENST00000546023 CLDND1Q9NY35 253 aa27.89■■■□□ 2.06
TCP1-217ENST00000546023 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 VCANP13611 3396 aa27.88■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 A0A0C4DFX4 3053 aa27.88■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 FSCN2O14926 492 aa27.88■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 TBCAO75347 108 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 FAM13AO94988 1023 aa27.88■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 KCNQ1P51787 676 aa27.88■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 RRAGBQ5VZM2 374 aa27.88■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 EP400NLQ6ZTU2 488 aa27.88■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa27.88■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 IGSF21Q96ID5 467 aa27.88■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 TNFSF13BQ9Y275 285 aa27.88■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 RECQL4O94761 1208 aa27.87■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 STRN3Q13033 797 aa27.87■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 ZNF568Q3ZCX4 644 aa27.87■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa27.87■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 PARVGQ9HBI0 331 aa27.87■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 SNTG2Q9NY99 539 aa27.87■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 KLK14Q9P0G3 267 aa27.87■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 H0YCG3 227 aa27.86■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP27.86■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 DDIT3P35638 169 aa27.86■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 STAT6P42226 847 aa27.86■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 NRIP1P48552 1158 aa27.86■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 ZNF131P52739 623 aa27.86■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 NCKAP1LP55160 1127 aa27.86■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 GRIK3Q13003 919 aa27.86■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 IGFLR1Q9H665 355 aa27.86■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 MAPTP10636 758 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 DSC1Q08554 894 aa27.85■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 GIT2Q14161 759 aa27.85■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 ATL3Q6DD88 541 aa27.85■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 TMC7Q7Z402 723 aa27.85■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 COLGALT2Q8IYK4 626 aa27.85■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 KCNG4Q8TDN1 519 aa27.85■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 CDT1Q9H211 546 aa27.85■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 ZHX3Q9H4I2 956 aa27.85■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 MIOSQ9NXC5 875 aa27.85■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 FSD2A1L4K1 749 aa27.84■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 H3BQ06 376 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 K7ENM7 598 aa27.84■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 OR1G1P47890 313 aa27.84■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 BECN1Q14457 450 aa27.84■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 CTC1Q2NKJ3 1217 aa27.84■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 LEXMQ3ZCV2 418 aa27.84■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 MYCT1Q8N699 235 aa27.84■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 GSTCDQ8NEC7 633 aa27.84■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 TLE6Q9H808 572 aa27.84■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 FAN1Q9Y2M0 1017 aa27.84■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 GDAQ9Y2T3 454 aa27.84■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 A0A087X0B3 334 aa27.83■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 DLL1O00548 723 aa27.83■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 NRP1O14786 923 aa27.83■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 LINC01565O15544 149 aa27.83■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 CUTAO60888 179 aa27.83■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 TBX10O75333 385 aa27.83■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 MPZL3Q6UWV2 235 aa27.83■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 EFHBQ8N7U6 833 aa27.83■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa27.83■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 ZBP1Q9H171 429 aa27.83■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 PTPRHQ9HD43 1115 aa27.83■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa27.83■■■□□ 2.05
TCP1-217ENST00000546023 NR1I2O75469 434 aa27.82■■■□□ 2.04
TCP1-217ENST00000546023 ALDH2P05091 517 aa27.82■■■□□ 2.04
TCP1-217ENST00000546023 SCP2P22307 547 aa27.82■■■□□ 2.04
TCP1-217ENST00000546023 PROZP22891 400 aa27.82■■■□□ 2.04
TCP1-217ENST00000546023 CA8P35219 290 aa27.82■■■□□ 2.04
TCP1-217ENST00000546023 NDUFV1P49821 464 aa27.82■■■□□ 2.04
TCP1-217ENST00000546023 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
TCP1-217ENST00000546023 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
TCP1-217ENST00000546023 DUSP6Q16828 381 aa27.82■■■□□ 2.04
TCP1-217ENST00000546023 SV2BQ7L1I2 683 aa27.82■■■□□ 2.04
TCP1-217ENST00000546023 HAUS6Q7Z4H7 955 aa27.82■■■□□ 2.04
TCP1-217ENST00000546023 VPS52Q8N1B4 723 aa27.82■■■□□ 2.04
TCP1-217ENST00000546023 MARCH5Q9NX47 278 aa27.82■■■□□ 2.04
TCP1-217ENST00000546023 STK39Q9UEW8 545 aa27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms