RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa6.45□□□□□ -1.38
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PTPRD-214ENST00000540109 P4HA2O15460 535 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 C21orf2O43822 256 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 ARHGAP4P98171 946 aa6.45□□□□□ -1.38
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PTPRD-214ENST00000540109 NEK9Q8TD19 979 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
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PTPRD-214ENST00000540109 CYP3A4P08684 503 aa6.45□□□□□ -1.38
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PTPRD-214ENST00000540109 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
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PTPRD-214ENST00000540109 GOLGA8HP0CJ92 632 aa6.44□□□□□ -1.38
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PTPRD-214ENST00000540109 AP1B1Q10567 949 aa6.44□□□□□ -1.38
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PTPRD-214ENST00000540109 RAPGEF1Q13905 1077 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 NAALADL2Q58DX5 795 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 SLC17A8Q8NDX2 589 aa6.44□□□□□ -1.38
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