RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533059.5

CHID1-222, Transcript of chitinase domain containing 1, human

TSL 3

Gene CHID1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHID1-222	ENST00000533059	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		15.18	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	POF1B	Q8WVV4	589 aa		15.18	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	TMEM169	Q96HH4	297 aa		15.18	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	GAD1	Q99259	594 aa		15.18	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	SNTG2	Q9NY99	539 aa		15.18	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	SPG21	Q9NZD8	308 aa		15.18	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	KLK14	Q9P0G3	267 aa		15.18	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		15.18	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		15.18	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	GDA	Q9Y2T3	454 aa		15.18	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		15.18	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		15.17	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	ARL5C	A6NH57	179 aa		15.17	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	MYMK	A6NI61	221 aa		15.17	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	GRM6	O15303	877 aa		15.17	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	EDN1	P05305	212 aa		15.17	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	ITGB1	P05556	798 aa		15.17	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	SCNN1G	P51170	649 aa		15.17	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	BCAR1	P56945	870 aa		15.17	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	ASIC1	P78348	528 aa		15.17	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	UBE3A	Q05086	875 aa		15.17	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		15.17	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	SFR1	Q86XK3	245 aa		15.17	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		15.17	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	STAM	Q92783	540 aa		15.17	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		15.17	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	RNF39	Q9H2S5	420 aa		15.17	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	PANK4	Q9NVE7	773 aa		15.17	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		15.17	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		15.17	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		15.16	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	TOM1L1	O75674	476 aa		15.16	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	RECQL4	O94761	1208 aa		15.16	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	GCNT3	O95395	438 aa		15.16	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	OR1G1	P47890	313 aa		15.16	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	OSTN	P61366	133 aa		15.16	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	GRIK3	Q13003	919 aa		15.16	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	15.16	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	ADAL	Q6DHV7	355 aa		15.16	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	ZPBP2	Q6X784	338 aa		15.16	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		15.16	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		15.16	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	ZFP42	Q96MM3	310 aa		15.16	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	CDT1	Q9H211	546 aa		15.16	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		15.16	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		15.16	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		15.16	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	TLR9	Q9NR96	1032 aa		15.16	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	TBX20	Q9UMR3	447 aa		15.16	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	MYO9B	Q13459	2157 aa		15.16	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		15.15	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		15.15	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059		A0A1B0GVL5	298 aa		15.15	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	CLDN3	O15551	220 aa		15.15	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	MCF2	P10911	925 aa		15.15	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	PFKFB1	P16118	471 aa		15.15	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	PLCB3	Q01970	1234 aa		15.15	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	E2F4	Q16254	413 aa		15.15	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		15.15	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		15.15	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		15.15	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		15.15	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		15.15	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		15.15	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		15.15	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		15.15	■□□□□ 0.02
CHID1-222	ENST00000533059	ALDH2	P05091	517 aa		15.14	■□□□□ 0.01
CHID1-222	ENST00000533059	CMA1	P23946	247 aa		15.14	■□□□□ 0.01
CHID1-222	ENST00000533059	GRM5	P41594	1212 aa		15.14	■□□□□ 0.01
CHID1-222	ENST00000533059	SYK	P43405	635 aa		15.14	■□□□□ 0.01
CHID1-222	ENST00000533059	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	15.14	■□□□□ 0.01
CHID1-222	ENST00000533059	ALCAM	Q13740	583 aa		15.14	■□□□□ 0.01
CHID1-222	ENST00000533059	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		15.14	■□□□□ 0.01
CHID1-222	ENST00000533059	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		15.14	■□□□□ 0.01
CHID1-222	ENST00000533059	TMC7	Q7Z402	723 aa		15.14	■□□□□ 0.01
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		15.14	■□□□□ 0.01
CHID1-222	ENST00000533059	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		15.14	■□□□□ 0.01
CHID1-222	ENST00000533059	FSIP1	Q8NA03	581 aa		15.14	■□□□□ 0.01
CHID1-222	ENST00000533059	HVCN1	Q96D96	273 aa		15.14	■□□□□ 0.01
CHID1-222	ENST00000533059	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		15.14	■□□□□ 0.01
CHID1-222	ENST00000533059	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		15.14	■□□□□ 0.01
CHID1-222	ENST00000533059	ACAP3	Q96P50	834 aa		15.14	■□□□□ 0.01
CHID1-222	ENST00000533059	TCF25	Q9BQ70	676 aa		15.14	■□□□□ 0.01
CHID1-222	ENST00000533059	TRIM9	Q9C026	710 aa		15.14	■□□□□ 0.01
CHID1-222	ENST00000533059	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		15.14	■□□□□ 0.01

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms