RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532280.1

PTENP1-202, Transcript of phosphatase and tensin homolog pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PTENP1, Length 3,996 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTENP1-202ENST00000532280 ITIH4Q14624 930 aa15.43■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 AADACL2Q6P093 401 aa15.43■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 ZBTB46Q86UZ6 589 aa15.43■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa15.43■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 A0A1B0GVG6 124 aa15.43■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 H3BRJ5 948 aa15.43■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 SNX3O60493 162 aa15.43■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 PIAS1O75925 651 aa15.43■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 TAF1P21675 1872 aa15.43■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 CALB2P22676 271 aa15.43■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 PIK3CAP42336 1068 aa15.43■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 ERMARDQ5T6L9 678 aa15.43■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 GALNT17Q6IS24 598 aa15.43■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 TRIM59Q8IWR1 403 aa15.43■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa15.43■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 MGRN1O60291 552 aa15.43■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 GSTA1P08263 222 aa15.43■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 ARFIP2P53365 341 aa15.43■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 IZUMO2Q6UXV1 221 aa15.43■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 ADGRF4Q8IZF3 695 aa15.43■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 ARHGAP18Q8N392 663 aa15.43■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 RAD54LQ92698 747 aa15.43■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 EPAS1Q99814 870 aa15.43■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 TRIM55Q9BYV6 548 aa15.43■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 LAD1O00515 517 aa15.43■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 ZBED4O75132 1171 aa15.43■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 HLA-DOAP06340 250 aa15.43■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 BBS9Q3SYG4 887 aa15.43■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 MMEL1Q495T6 779 aa15.43■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 MIIPQ5JXC2 388 aa15.43■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 FAM228AQ86W67 206 aa15.43■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 SMC1BQ8NDV3 1235 aa15.43■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 NEDD1Q8NHV4 660 aa15.43■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 SLC35G2Q8TBE7 412 aa15.43■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 UCMAQ8WVF2 138 aa15.43■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 PNMA5Q96PV4 448 aa15.43■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 SIKE1Q9BRV8 207 aa15.43■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa15.43■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 DNM3Q9UQ16 869 aa15.43■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 NOL3O60936 208 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 PLA2G4BP0C869 781 aa15.42■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP15.42■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa15.42■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 TPH2Q8IWU9 490 aa15.42■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 NDNQ99608 321 aa15.42■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 C7orf25Q9BPX7 421 aa15.42■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa15.42■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 ADAM22Q9P0K1 906 aa15.42■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa15.42■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 MYH7P12883 1935 aa15.42■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 PEX5P50542 639 aa15.42■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 RAB27AP51159 221 aa15.42■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 MED21Q13503 144 aa15.42■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 BLMHQ13867 455 aa15.42■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 TRIP10Q15642 601 aa15.42■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 MIGA2Q7L4E1 593 aa15.42■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 SLF2Q8IX21 1173 aa15.42■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 STK32AQ8WU08 396 aa15.42■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 DBNDD1Q9H9R9 158 aa15.42■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 LAMB4A4D0S4 1761 aa15.42■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 B2RBV5 119 aa15.42■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 ADCY3O60266 1144 aa15.42■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 GNA14O95837 355 aa15.42■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 TRIM49P0CI25 452 aa15.42■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 TRIM49CP0CI26 452 aa15.42■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 HARSP12081 509 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 KLHL23Q8NBE8 558 aa15.42■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 ATG4AQ8WYN0 398 aa15.42■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 MPP4Q96JB8 637 aa15.42■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 CLDN3O15551 220 aa15.41■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 LMNAP02545 664 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 LRRC63Q05C16 580 aa15.41■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 UTS2BQ765I0 119 aa15.41■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 ANKMY2Q8IV38 441 aa15.41■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 ERGIC2Q96RQ1 377 aa15.41■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 MYLK2Q9H1R3 596 aa15.41■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa15.41■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa15.41■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP15.41■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 ATP5HO75947 161 aa15.41■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 KRT36O76013 467 aa15.41■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 PGM3O95394 542 aa15.41■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 POLD1P28340 1107 aa15.41■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 KRT17Q04695 432 aa15.41■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 GINM1Q9NU53 330 aa15.41■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 DNAJC12Q9UKB3 198 aa15.41■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa15.41■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa15.41■□□□□ 0.06
PTENP1-202ENST00000532280 RNF8O76064 485 aa15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms