RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 STYXL1Q9Y6J8 313 aa9.28□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A1B0GUA9 196 aa9.27□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OGTO15294 1046 aa9.27□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AP5Z1O43299 807 aa9.27□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NPTXRO95502 500 aa9.27□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TPM3P06753 285 aa9.27□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MCF2P10911 925 aa9.27□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa9.27□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM174Q8WUU8 243 aa9.27□□□□□ -0.93
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM212AQ96EL1 285 aa9.27□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MKNK1Q9BUB5 465 aa9.27□□□□□ -0.93
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa9.27□□□□□ -0.93
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CDT1Q9H211 546 aa9.27□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HIPK3Q9H422 1215 aa9.27□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PTPRHQ9HD43 1115 aa9.27□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa9.27□□□□□ -0.93
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP9.27□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa9.27□□□□□ -0.93
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MAPK13O15264 365 aa9.26□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ADCY5O95622 1261 aa9.26□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CLTBP09497 229 aa9.26□□□□□ -0.93
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CCL23P55773 120 aa9.26□□□□□ -0.93
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 STX10O60499 249 aa9.25□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ADRB2P07550 413 aa9.25□□□□□ -0.93
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CYP24A1Q07973 514 aa9.25□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RBL2Q08999 1139 aa9.25□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NR1I3Q14994 352 aa9.25□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRAF7Q6Q0C0 670 aa9.25□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRIM59Q8IWR1 403 aa9.25□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SEPT8Q92599 483 aa9.25□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BORCS6Q96GS4 357 aa9.25□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SCLYQ96I15 445 aa9.25□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FBXL18Q96ME1 805 aa9.25□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ACAP3Q96P50 834 aa9.25□□□□□ -0.93
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