RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530003.5

RPS6KA1-216, Transcript of ribosomal protein S6 kinase A1, human

TSL 5 BASIC

Gene RPS6KA1, Length 3,023 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS6KA1-216	ENST00000530003	RARRES1	P49788	294 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	TNIP1	Q15025	636 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	LONRF1	Q17RB8	773 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	DENND2C	Q68D51	928 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	OGFOD1	Q8N543	542 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	WNK4	Q96J92	1243 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	SYT11	Q9BT88	431 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	PIK3CD	O00329	1044 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	CCDC114	Q96M63	670 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	VCPKMT	Q9H867	229 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	TBK1	Q9UHD2	729 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	CHRNB2	P17787	502 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	ZNF131	P52739	623 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	MTMR1	Q13613	665 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	PPP1R7	Q15435	360 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	SEZ6	Q53EL9	994 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	DUPD1	Q68J44	220 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	RAB17	Q9H0T7	212 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	NCAN	O14594	1321 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	DNM1L	O00429	736 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	EGFR	P00533	1210 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	RARA	P10276	462 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	GPC5	P78333	572 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	MTM1	Q13496	603 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	NEK9	Q8TD19	979 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	JDP2	Q8WYK2	163 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	CARD9	Q9H257	536 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	RPTOR	Q8N122	1335 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	LTBP1	Q14766	1721 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	TRAPPC3	O43617	180 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	PEX10	O60683	326 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	ADSS	P30520	456 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	CETN1	Q12798	172 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	TKFC	Q3LXA3	575 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	BSND	Q8WZ55	320 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	BICD1	Q96G01	975 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	UST	Q9Y2C2	406 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	DENND3	A2RUS2	1198 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	CES2	O00748	559 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	ENTPD3	O75355	529 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	MTMR3	Q13615	1198 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	KIF22	Q14807	665 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	ACCS	Q96QU6	501 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RPS6KA1-216	ENST00000530003	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		11.15	□□□□□ -0.62

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