RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525711.1

UBASH3B-202, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 4

Gene UBASH3B, Length 572 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-202ENST00000525711 USP41Q3LFD5 358 aa15.84■□□□□ 0.13
UBASH3B-202ENST00000525711 UBXN11Q5T124 520 aa15.84■□□□□ 0.13
UBASH3B-202ENST00000525711 GPR65Q8IYL9 337 aa15.84■□□□□ 0.13
UBASH3B-202ENST00000525711 SUMF1Q8NBK3 374 aa15.84■□□□□ 0.13
UBASH3B-202ENST00000525711 TCP11Q8WWU5 503 aa15.84■□□□□ 0.13
UBASH3B-202ENST00000525711 SLC26A6Q9BXS9 759 aa15.84■□□□□ 0.13
UBASH3B-202ENST00000525711 SH3GLB2Q9NR46 395 aa15.84■□□□□ 0.13
UBASH3B-202ENST00000525711 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
UBASH3B-202ENST00000525711 FNIP2Q9P278 1114 aa15.84■□□□□ 0.13
UBASH3B-202ENST00000525711 FBXO4Q9UKT5 387 aa15.84■□□□□ 0.13
UBASH3B-202ENST00000525711 TPCN1Q9ULQ1 816 aa15.84■□□□□ 0.13
UBASH3B-202ENST00000525711 IPPQ9Y573 584 aa15.84■□□□□ 0.13
UBASH3B-202ENST00000525711 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa15.83■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 KANSL1LA0AUZ9 987 aa15.83■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 ASAP2O43150 1006 aa15.83■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 PFKFB2O60825 505 aa15.83■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 TDP2O95551 362 aa15.83■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 EFEMP2O95967 443 aa15.83■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 FSHRP23945 695 aa15.83■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 CYP3A7P24462 503 aa15.83■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 AXLP30530 894 aa15.83■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 RFC5P40937 340 aa15.83■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 QARSP47897 775 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 DSC1Q08554 894 aa15.83■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa15.83■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 NOTUMQ6P988 496 aa15.83■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 MOXD1Q6UVY6 613 aa15.83■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 MTSS1LQ765P7 747 aa15.83■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 GLYCTKQ8IVS8 523 aa15.83■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 CCDC51Q96ER9 411 aa15.83■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 CEP170P1Q96L14 293 aa15.83■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 GAD1Q99259 594 aa15.83■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 MINDY3Q9H8M7 445 aa15.83■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 CHST7Q9NS84 486 aa15.83■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa15.83■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 POTEMA6NI47 508 aa15.82■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 GLULP15104 373 aa15.82■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 MAGEA9P43362 315 aa15.82■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 MCM2P49736 904 aa15.82■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 SCNN1GP51170 649 aa15.82■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 NPEPPSP55786 919 aa15.82■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 PRKCQQ04759 706 aa15.82■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 FUT10Q6P4F1 479 aa15.82■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 POTEGQ6S5H5 508 aa15.82■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 RNF149Q8NC42 400 aa15.82■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 ETNPPLQ8TBG4 499 aa15.82■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 TMEM143Q96AN5 459 aa15.82■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa15.82■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa15.82■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 GIT1Q9Y2X7 761 aa15.82■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa15.82■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 NCOR2Q9Y618 2525 aa15.82■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 M0R2N6 131 aa15.81■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 ZMYND10O75800 440 aa15.81■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 IFNAR1P17181 557 aa15.81■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 PFKPQ01813 784 aa15.81■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 UBXN2BQ14CS0 331 aa15.81■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 ME3Q16798 604 aa15.81■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 LIN9Q5TKA1 542 aa15.81■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa15.81■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 FERMT3Q86UX7 667 aa15.81■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 TRIM22Q8IYM9 498 aa15.81■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 ATRIPQ8WXE1 791 aa15.81■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 FGF14Q92915 247 aa15.81■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 MBOAT7Q96N66 472 aa15.81■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 APOL6Q9BWW8 343 aa15.81■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 OSBPL6Q9BZF3 934 aa15.81■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 ADAM28Q9UKQ2 775 aa15.81■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 CDH7Q9ULB5 785 aa15.81■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 PCDHA4Q9UN74 947 aa15.81■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 VWA8A3KMH1 1905 aa15.8■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa15.8■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 LRRN2O75325 713 aa15.8■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 P4HBP07237 508 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 GPC5P78333 572 aa15.8■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 CCT2P78371 535 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 ARHGAP8P85298 464 aa15.8■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 PPP2R5CQ13362 524 aa15.8■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 EMC2Q15006 297 aa15.8■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 NPY5RQ15761 445 aa15.8■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 LILRA6Q6PI73 481 aa15.8■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 OTUD6AQ7L8S5 288 aa15.8■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 B3GALT6Q96L58 329 aa15.8■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 ZFP42Q96MM3 310 aa15.8■□□□□ 0.12
UBASH3B-202ENST00000525711 MTRQ99707 1265 aa15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms