RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522344.1

CPEB4-210, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene CPEB4, Length 481 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB4-210ENST00000522344 PER3P56645 1201 aa5.8□□□□□ -1.48
CPEB4-210ENST00000522344 ERVK-21P61565 698 aa5.8□□□□□ -1.48
CPEB4-210ENST00000522344 NOMO1Q15155 1222 aa5.8□□□□□ -1.48
CPEB4-210ENST00000522344 MUM1L1Q5H9M0 696 aa5.8□□□□□ -1.48
CPEB4-210ENST00000522344 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
CPEB4-210ENST00000522344 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa5.8□□□□□ -1.48
CPEB4-210ENST00000522344 ANKS6Q68DC2 871 aa5.8□□□□□ -1.48
CPEB4-210ENST00000522344 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
CPEB4-210ENST00000522344 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
CPEB4-210ENST00000522344 REPS2Q8NFH8 660 aa5.8□□□□□ -1.48
CPEB4-210ENST00000522344 GPR156Q8NFN8 814 aa5.8□□□□□ -1.48
CPEB4-210ENST00000522344 SLC2A13Q96QE2 648 aa5.8□□□□□ -1.48
CPEB4-210ENST00000522344 ADI1Q9BV57 179 aa5.8□□□□□ -1.48
CPEB4-210ENST00000522344 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
CPEB4-210ENST00000522344 DMRT3Q9NQL9 472 aa5.8□□□□□ -1.48
CPEB4-210ENST00000522344 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
CPEB4-210ENST00000522344 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa5.8□□□□□ -1.48
CPEB4-210ENST00000522344 GASTP01350 101 aa5.79□□□□□ -1.48
CPEB4-210ENST00000522344 ECHS1P30084 290 aa5.79□□□□□ -1.48
CPEB4-210ENST00000522344 SLC5A3P53794 718 aa5.79□□□□□ -1.48
CPEB4-210ENST00000522344 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
CPEB4-210ENST00000522344 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
CPEB4-210ENST00000522344 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
CPEB4-210ENST00000522344 RABL3Q5HYI8 236 aa5.79□□□□□ -1.48
CPEB4-210ENST00000522344 PGM2L1Q6PCE3 622 aa5.79□□□□□ -1.48
CPEB4-210ENST00000522344 PPM1NQ8N819 430 aa5.79□□□□□ -1.48
CPEB4-210ENST00000522344 CPT1CQ8TCG5 803 aa5.79□□□□□ -1.48
CPEB4-210ENST00000522344 GREM2Q9H772 168 aa5.79□□□□□ -1.48
CPEB4-210ENST00000522344 MMRN2Q9H8L6 949 aa5.79□□□□□ -1.48
CPEB4-210ENST00000522344 POGKQ9P215 609 aa5.79□□□□□ -1.48
CPEB4-210ENST00000522344 DNM3Q9UQ16 869 aa5.79□□□□□ -1.48
CPEB4-210ENST00000522344 NARSO43776 548 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
CPEB4-210ENST00000522344 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
CPEB4-210ENST00000522344 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
CPEB4-210ENST00000522344 MCM7P33993 719 aa5.78□□□□□ -1.48
CPEB4-210ENST00000522344 CRHR1P34998 444 aa5.78□□□□□ -1.48
CPEB4-210ENST00000522344 GUCY2FP51841 1108 aa5.78□□□□□ -1.48
CPEB4-210ENST00000522344 EVA1CP58658 441 aa5.78□□□□□ -1.48
CPEB4-210ENST00000522344 SLC25A3Q00325 362 aa5.78□□□□□ -1.48
CPEB4-210ENST00000522344 ABHD18Q0P651 414 aa5.78□□□□□ -1.48
CPEB4-210ENST00000522344 VPS72Q15906 364 aa5.78□□□□□ -1.48
CPEB4-210ENST00000522344 MST1LQ2TV78 715 aa5.78□□□□□ -1.48
CPEB4-210ENST00000522344 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
CPEB4-210ENST00000522344 DOK3Q7L591 496 aa5.78□□□□□ -1.48
CPEB4-210ENST00000522344 OR52N2Q8NGI0 321 aa5.78□□□□□ -1.48
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
CPEB4-210ENST00000522344 CEP95Q96GE4 821 aa5.78□□□□□ -1.48
CPEB4-210ENST00000522344 PDCD2LQ9BRP1 358 aa5.78□□□□□ -1.48
CPEB4-210ENST00000522344 TRIM8Q9BZR9 551 aa5.78□□□□□ -1.48
CPEB4-210ENST00000522344 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
CPEB4-210ENST00000522344 TRPS1Q9UHF7 1281 aa5.78□□□□□ -1.48
CPEB4-210ENST00000522344 GPR45Q9Y5Y3 372 aa5.78□□□□□ -1.48
CPEB4-210ENST00000522344 RECQL4O94761 1208 aa5.77□□□□□ -1.49
CPEB4-210ENST00000522344 MT-CO1P00395 513 aa5.77□□□□□ -1.49
CPEB4-210ENST00000522344 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
CPEB4-210ENST00000522344 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
CPEB4-210ENST00000522344 ACVRL1P37023 503 aa5.77□□□□□ -1.49
CPEB4-210ENST00000522344 IARSP41252 1262 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
CPEB4-210ENST00000522344 PTTG1IPP53801 180 aa5.77□□□□□ -1.49
CPEB4-210ENST00000522344 ITKQ08881 620 aa5.77□□□□□ -1.49
CPEB4-210ENST00000522344 MALLQ13021 153 aa5.77□□□□□ -1.49
CPEB4-210ENST00000522344 KLF10Q13118 480 aa5.77□□□□□ -1.49
CPEB4-210ENST00000522344 ACAP2Q15057 778 aa5.77□□□□□ -1.49
CPEB4-210ENST00000522344 ANO4Q32M45 955 aa5.77□□□□□ -1.49
CPEB4-210ENST00000522344 MFSD14BQ5SR56 506 aa5.77□□□□□ -1.49
CPEB4-210ENST00000522344 EFCAB12Q6NXP0 572 aa5.77□□□□□ -1.49
CPEB4-210ENST00000522344 Q6ZVL8 140 aa5.77□□□□□ -1.49
CPEB4-210ENST00000522344 HTR3DQ70Z44 454 aa5.77□□□□□ -1.49
CPEB4-210ENST00000522344 NECAB2Q7Z6G3 386 aa5.77□□□□□ -1.49
CPEB4-210ENST00000522344 PQLC1Q8N2U9 271 aa5.77□□□□□ -1.49
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF276Q8N554 614 aa5.77□□□□□ -1.49
CPEB4-210ENST00000522344 RNF169Q8NCN4 708 aa5.77□□□□□ -1.49
CPEB4-210ENST00000522344 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
CPEB4-210ENST00000522344 STON2Q8WXE9 905 aa5.77□□□□□ -1.49
CPEB4-210ENST00000522344 TFAP2CQ92754 450 aa5.77□□□□□ -1.49
CPEB4-210ENST00000522344 CLIP3Q96DZ5 547 aa5.77□□□□□ -1.49
CPEB4-210ENST00000522344 MTMR8Q96EF0 704 aa5.77□□□□□ -1.49
CPEB4-210ENST00000522344 PHACTR3Q96KR7 559 aa5.77□□□□□ -1.49
CPEB4-210ENST00000522344 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
CPEB4-210ENST00000522344 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
CPEB4-210ENST00000522344 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa5.77□□□□□ -1.49
CPEB4-210ENST00000522344 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
CPEB4-210ENST00000522344 B5MCH6 92 aa5.76□□□□□ -1.49
CPEB4-210ENST00000522344 CYR61O00622 381 aa5.76□□□□□ -1.49
CPEB4-210ENST00000522344 MYBL2P10244 700 aa5.76□□□□□ -1.49
CPEB4-210ENST00000522344 MAKP20794 623 aa5.76□□□□□ -1.49
CPEB4-210ENST00000522344 MTNR1BP49286 362 aa5.76□□□□□ -1.49
CPEB4-210ENST00000522344 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
CPEB4-210ENST00000522344 AMPD3Q01432 767 aa5.76□□□□□ -1.49
CPEB4-210ENST00000522344 PPP3CAQ08209 521 aa5.76□□□□□ -1.49
CPEB4-210ENST00000522344 FNDC7Q5VTL7 733 aa5.76□□□□□ -1.49
CPEB4-210ENST00000522344 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
CPEB4-210ENST00000522344 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
CPEB4-210ENST00000522344 OR7D4Q8NG98 312 aa5.76□□□□□ -1.49
CPEB4-210ENST00000522344 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
CPEB4-210ENST00000522344 NDC1Q9BTX1 674 aa5.76□□□□□ -1.49
CPEB4-210ENST00000522344 LDAHQ9H6V9 325 aa5.76□□□□□ -1.49
CPEB4-210ENST00000522344 BCO1Q9HAY6 547 aa5.76□□□□□ -1.49
CPEB4-210ENST00000522344 MKS1Q9NXB0 559 aa5.76□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms