RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 ADCYAP1R1P41586 468 aa6.98□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 NHLH2Q02577 135 aa6.98□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 FKBP9P1Q75LS8 142 aa6.98□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 PRIMA1Q86XR5 153 aa6.98□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 LCORLQ8N3X6 602 aa6.98□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 OR10H5Q8NGA6 315 aa6.98□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 WDR11Q9BZH6 1224 aa6.98□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa6.98□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 PLAAQ9Y263 795 aa6.98□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 NDUFA10O95299 355 aa6.97□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 CLEC2LP0C7M8 214 aa6.97□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 SPATA31D3P0C874 917 aa6.97□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 AVPR1BP47901 424 aa6.97□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 DDB1Q16531 1140 aa6.97□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 BEAN1Q3B7T3 259 aa6.97□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 C19orf54Q5BKX5 351 aa6.97□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 STRIP1Q5VSL9 837 aa6.97□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 CCDC62Q6P9F0 684 aa6.97□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 OLFML1Q6UWY5 402 aa6.97□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa6.97□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 LYSMD2Q8IV50 215 aa6.97□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa6.97□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 PTGFRNQ9P2B2 879 aa6.97□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 CDC45O75419 566 aa6.96□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 ITGA10O75578 1167 aa6.96□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 RBP3P10745 1247 aa6.96□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 BMPR1AP36894 532 aa6.96□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 CCDC142Q17RM4 750 aa6.96□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 BROXQ5VW32 411 aa6.96□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 EFCAB12Q6NXP0 572 aa6.96□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 SYT12Q8IV01 421 aa6.96□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 SNX33Q8WV41 574 aa6.96□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 SLC5A5Q92911 643 aa6.96□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 MFSD3Q96ES6 412 aa6.96□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 FEZ1Q99689 392 aa6.96□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 EMC7Q9NPA0 242 aa6.96□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 CDY2AQ9Y6F7 541 aa6.96□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 ZMYM3Q14202 1370 aa6.95□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 TMEM127O75204 238 aa6.95□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 ABHD15Q6UXT9 468 aa6.95□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 TFAP2CQ92754 450 aa6.95□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 POGKQ9P215 609 aa6.95□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 TBKBP1A7MCY6 615 aa6.94□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 GASTP01350 101 aa6.94□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 HLA-DOAP06340 250 aa6.94□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 GUCY1B3Q02153 619 aa6.94□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 CSRP2Q16527 193 aa6.94□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 ANKS6Q68DC2 871 aa6.94□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 BTNL9Q6UXG8 535 aa6.94□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 ADGRG3Q86Y34 549 aa6.94□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 MDM1Q8TC05 714 aa6.94□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 GPRC5DQ9NZD1 345 aa6.94□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 DKK2Q9UBU2 259 aa6.94□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 PITRM1Q5JRX3 1037 aa6.93□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 RASSF3Q86WH2 238 aa6.93□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 RNF169Q8NCN4 708 aa6.93□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 ZFP28Q8NHY6 868 aa6.93□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 ZNF480Q8WV37 535 aa6.93□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 COQ10AQ96MF6 247 aa6.93□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 TEX101Q9BY14 249 aa6.93□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 KCTD10Q9H3F6 313 aa6.93□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 PRDM12Q9H4Q4 367 aa6.93□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 SYNPO2LQ9H987 977 aa6.93□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 SYBUQ9NX95 663 aa6.93□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.93□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 KIAA0355O15063 1070 aa6.92□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 ZNF185O15231 689 aa6.92□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 LPLP06858 475 aa6.92□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 CTSSP25774 331 aa6.92□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP6.92□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 CRHR1P34998 444 aa6.92□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 LGALS4P56470 323 aa6.92□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 BLOC1S1P78537 153 aa6.92□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 MXRA7P84157 204 aa6.92□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 BMT2Q1RMZ1 405 aa6.92□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 CAVIN3Q969G5 261 aa6.92□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 UNC119BA6NIH7 251 aa6.91□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 HKR1P10072 659 aa6.91□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 FLT3LGP49771 235 aa6.91□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa6.91□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.91□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 CEP95Q96GE4 821 aa6.91□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa6.91□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 PIPSLA2A3N6 862 aa6.9□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 GSG1L2A8MUP6 293 aa6.9□□□□□ -1.3
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