RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521017.5

CCNC-211, Transcript of cyclin C, humanhuman

TSL 4

Gene CCNC, Length 579 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNC-211ENST00000521017 HES2Q9Y543 173 aa11.69□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 ITPR1Q14643 2758 aa11.69□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 AXIN1O15169 862 aa11.68□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 FCARP24071 287 aa11.68□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 LIMK1P53667 647 aa11.68□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 PFKPQ01813 784 aa11.68□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 FUT2Q10981 343 aa11.68□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 GRM2Q14416 872 aa11.68□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 STPG1Q5TH74 334 aa11.68□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 MTSS1LQ765P7 747 aa11.68□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 CATSPER4Q7RTX7 472 aa11.68□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 GSTCDQ8NEC7 633 aa11.68□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 NCOA7Q8NI08 942 aa11.68□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 URGCPQ8TCY9 931 aa11.68□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 LENG9Q96B70 501 aa11.68□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 MCRS1Q96EZ8 462 aa11.68□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 NELL2Q99435 816 aa11.68□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 PAAF1Q9BRP4 392 aa11.68□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa11.68□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 NCANO14594 1321 aa11.67□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 BPTFQ12830 3046 aa11.67□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 MIA3Q5JRA6 1907 aa11.67□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 ARL5CA6NH57 179 aa11.67□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 CYSRT1A8MQ03 144 aa11.67□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 CHRNB1P11230 501 aa11.67□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 SKIP12755 728 aa11.67□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP11.67□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 MLH1P40692 756 aa11.67□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 SCNN1GP51170 649 aa11.67□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 NAPAP54920 295 aa11.67□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 MTERF2Q49AM1 385 aa11.67□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa11.67□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa11.67□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 FUT10Q6P4F1 479 aa11.67□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 RHPN2Q8IUC4 686 aa11.67□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 GATA6Q92908 595 aa11.67□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 PGBD4Q96DM1 585 aa11.67□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 NLRP4Q96MN2 994 aa11.67□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 LRRC2Q9BYS8 371 aa11.67□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa11.67□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 OSBPL3Q9H4L5 887 aa11.67□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 NRBP2Q9NSY0 501 aa11.67□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 FNIP2Q9P278 1114 aa11.67□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 DPP7Q9UHL4 492 aa11.67□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 POLIQ9UNA4 740 aa11.67□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 LHX6Q9UPM6 363 aa11.67□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa11.67□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 MAST4O15021 2626 aa11.66□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 CARNS1A5YM72 827 aa11.66□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 SMCO2A6NFE2 343 aa11.66□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 TAF4O00268 1085 aa11.66□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 NCAM2O15394 837 aa11.66□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 FOSP01100 380 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 C8AP07357 584 aa11.66□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 CYP3A4P08684 503 aa11.66□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 GNAQP50148 359 aa11.66□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 RAB27AP51159 221 aa11.66□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 ADCY7P51828 1080 aa11.66□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 NRLP54845 237 aa11.66□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 PRR16Q569H4 304 aa11.66□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 TCEAL6Q6IPX3 200 aa11.66□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 Q6ZS52 159 aa11.66□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 ZNF710Q8N1W2 664 aa11.66□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 RSPH1Q8WYR4 309 aa11.66□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 TCEAL3Q969E4 200 aa11.66□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 FAM167AQ96KS9 214 aa11.66□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 CXCL16Q9H2A7 254 aa11.66□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 DISC1Q9NRI5 854 aa11.66□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 TBC1D22BQ9NU19 505 aa11.66□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 KANSL3Q9P2N6 904 aa11.66□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 STK39Q9UEW8 545 aa11.66□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 SAMM50Q9Y512 469 aa11.66□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 MYH15Q9Y2K3 1946 aa11.66□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 NOTCH4Q99466 2003 aa11.65□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa11.65□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 CHMP2AO43633 222 aa11.65□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 PRC1O43663 620 aa11.65□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 ECI2O75521 394 aa11.65□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 C1RP00736 705 aa11.65□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 CEBPBP17676 345 aa11.65□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 CXCL12P48061 93 aa11.65□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 FOXC1Q12948 553 aa11.65□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 SART3Q15020 963 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 USP41Q3LFD5 358 aa11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms