RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515707.1

ABCC3-217, Transcript of ATP binding cassette subfamily C member 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene ABCC3, Length 656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC3-217ENST00000515707 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
ABCC3-217ENST00000515707 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
ABCC3-217ENST00000515707 DSC1Q08554 894 aa22.23■■□□□ 1.15
ABCC3-217ENST00000515707 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
ABCC3-217ENST00000515707 DUSP6Q16828 381 aa22.23■■□□□ 1.15
ABCC3-217ENST00000515707 ATF7IP2Q5U623 682 aa22.23■■□□□ 1.15
ABCC3-217ENST00000515707 EEF1DP3Q658K8 133 aa22.23■■□□□ 1.15
ABCC3-217ENST00000515707 TMC7Q7Z402 723 aa22.23■■□□□ 1.15
ABCC3-217ENST00000515707 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
ABCC3-217ENST00000515707 SPIRE2Q8WWL2 714 aa22.23■■□□□ 1.15
ABCC3-217ENST00000515707 RAD54LQ92698 747 aa22.23■■□□□ 1.15
ABCC3-217ENST00000515707 TMEM134Q9H6X4 195 aa22.23■■□□□ 1.15
ABCC3-217ENST00000515707 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
ABCC3-217ENST00000515707 HIDE1A8MVS5 230 aa22.22■■□□□ 1.15
ABCC3-217ENST00000515707 SLC16A4O15374 487 aa22.22■■□□□ 1.15
ABCC3-217ENST00000515707 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
ABCC3-217ENST00000515707 GRIK3Q13003 919 aa22.22■■□□□ 1.15
ABCC3-217ENST00000515707 ARSHQ5FYA8 562 aa22.22■■□□□ 1.15
ABCC3-217ENST00000515707 NT5DC1Q5TFE4 455 aa22.22■■□□□ 1.15
ABCC3-217ENST00000515707 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
ABCC3-217ENST00000515707 GPBP1Q86WP2 473 aa22.22■■□□□ 1.15
ABCC3-217ENST00000515707 COLGALT2Q8IYK4 626 aa22.22■■□□□ 1.15
ABCC3-217ENST00000515707 GSTCDQ8NEC7 633 aa22.22■■□□□ 1.15
ABCC3-217ENST00000515707 RPS6KC1Q96S38 1066 aa22.22■■□□□ 1.15
ABCC3-217ENST00000515707 ZBP1Q9H171 429 aa22.22■■□□□ 1.15
ABCC3-217ENST00000515707 STK39Q9UEW8 545 aa22.22■■□□□ 1.15
ABCC3-217ENST00000515707 PARP2Q9UGN5 583 aa22.22■■□□□ 1.15
ABCC3-217ENST00000515707 ODF2LQ9ULJ1 636 aa22.22■■□□□ 1.15
ABCC3-217ENST00000515707 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa22.21■■□□□ 1.15
ABCC3-217ENST00000515707 GRXCR2A6NFK2 248 aa22.21■■□□□ 1.15
ABCC3-217ENST00000515707 SFI1A8K8P3 1242 aa22.21■■□□□ 1.15
ABCC3-217ENST00000515707 TNFRSF10AO00220 468 aa22.21■■□□□ 1.15
ABCC3-217ENST00000515707 PER2O15055 1255 aa22.21■■□□□ 1.15
ABCC3-217ENST00000515707 RECQL4O94761 1208 aa22.21■■□□□ 1.15
ABCC3-217ENST00000515707 NASPP49321 788 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
ABCC3-217ENST00000515707 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
ABCC3-217ENST00000515707 SLC39A14Q15043 492 aa22.21■■□□□ 1.15
ABCC3-217ENST00000515707 USP49Q70CQ1 688 aa22.21■■□□□ 1.15
ABCC3-217ENST00000515707 TAS1R3Q7RTX0 852 aa22.21■■□□□ 1.15
ABCC3-217ENST00000515707 VPS52Q8N1B4 723 aa22.21■■□□□ 1.15
ABCC3-217ENST00000515707 EPSTI1Q96J88 318 aa22.21■■□□□ 1.15
ABCC3-217ENST00000515707 REEP2Q9BRK0 252 aa22.21■■□□□ 1.15
ABCC3-217ENST00000515707 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
ABCC3-217ENST00000515707 VN1R3Q9BXE9 311 aa22.21■■□□□ 1.15
ABCC3-217ENST00000515707 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
ABCC3-217ENST00000515707 KLK14Q9P0G3 267 aa22.21■■□□□ 1.15
ABCC3-217ENST00000515707 KCNG1Q9UIX4 513 aa22.21■■□□□ 1.15
ABCC3-217ENST00000515707 FAM50BQ9Y247 325 aa22.21■■□□□ 1.15
ABCC3-217ENST00000515707 TNFSF13BQ9Y275 285 aa22.21■■□□□ 1.15
ABCC3-217ENST00000515707 FAN1Q9Y2M0 1017 aa22.21■■□□□ 1.15
ABCC3-217ENST00000515707 C2orf71A6NGG8 1288 aa22.2■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 NRP1O14786 923 aa22.2■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 TXLNAP40222 546 aa22.2■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 SMTNP53814 917 aa22.2■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 MCM6Q14566 821 aa22.2■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 CLUL1Q15846 466 aa22.2■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 SPECC1Q5M775 1068 aa22.2■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa22.2■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 VN1R2Q8NFZ6 395 aa22.2■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 MSLNLQ96KJ4 702 aa22.2■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 CLIC6Q96NY7 704 aa22.2■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 MARCH5Q9NX47 278 aa22.2■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 MIOSQ9NXC5 875 aa22.2■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 CLEC1BQ9P126 229 aa22.2■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 STK17AQ9UEE5 414 aa22.2■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 CD207Q9UJ71 328 aa22.2■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 C5orf42Q9H799 3197 aa22.2■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 TRIP11Q15643 1979 aa22.19■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 CITO14578 2027 aa22.19■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 ALDH2P05091 517 aa22.19■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 SRGAP2BP0DMP2 458 aa22.19■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 CTSAP10619 480 aa22.19■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 IL9P15248 144 aa22.19■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 OR1G1P47890 313 aa22.19■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 ZNF568Q3ZCX4 644 aa22.19■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 CDT1Q9H211 546 aa22.19■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 SNTG2Q9NY99 539 aa22.19■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 NR1I2O75469 434 aa22.18■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 MAPTP10636 758 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 RBM10P98175 930 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 STRN3Q13033 797 aa22.18■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 COASYQ13057 564 aa22.18■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 KCNC3Q14003 757 aa22.18■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 STK38Q15208 465 aa22.18■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 SMRP1Q8NCR6 262 aa22.18■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 PTPRHQ9HD43 1115 aa22.18■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 CCDC39Q9UFE4 941 aa22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms