RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 GLUD2P49448 558 aa18.76■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP18.76■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 KIAA0319Q5VV43 1072 aa18.76■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 SLC27A1Q6PCB7 646 aa18.76■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 CCDC149Q6ZUS6 474 aa18.76■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 GSTCDQ8NEC7 633 aa18.76■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 COLEC11Q9BWP8 271 aa18.76■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 TUFT1Q9NNX1 390 aa18.76■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 MAN1C1Q9NR34 630 aa18.76■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 KLK14Q9P0G3 267 aa18.76■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 MYO10Q9HD67 2058 aa18.76■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 ADH1AP07327 375 aa18.75■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 MYBP10242 640 aa18.75■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 B3GALT6Q96L58 329 aa18.75■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 NACC1Q96RE7 527 aa18.75■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 RXFP1Q9HBX9 757 aa18.75■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 PARP2Q9UGN5 583 aa18.75■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa18.75■□□□□ 0.59
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HERC3-211ENST00000513325 ZNF174Q15697 407 aa18.74■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 ERICH6BQ5W0A0 696 aa18.74■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa18.74■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 OTOP3Q7RTS5 596 aa18.74■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 CCDC83Q8IWF9 413 aa18.74■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 MCPH1Q8NEM0 835 aa18.74■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 RABGGTAQ92696 567 aa18.74■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 C8orf76Q96K31 380 aa18.74■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 CHST7Q9NS84 486 aa18.74■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa18.74■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 DENND4AQ7Z401 1863 aa18.73■□□□□ 0.59
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HERC3-211ENST00000513325 GLUD1P00367 558 aa18.73■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 OR52Z1P0C646 297 aa18.73■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 GRIK3Q13003 919 aa18.73■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 FUT10Q6P4F1 479 aa18.73■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 POTEGQ6S5H5 508 aa18.73■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 PADI6Q6TGC4 694 aa18.73■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa18.73■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa18.73■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
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HERC3-211ENST00000513325 GPR62Q9BZJ7 368 aa18.73■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 FZD8Q9H461 694 aa18.73■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa18.72■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 TTLL13PA6NNM8 815 aa18.72■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 SPATA31D3P0C874 917 aa18.72■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 RPA1P27694 616 aa18.72■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa18.72■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 ERMNQ8TAM6 284 aa18.72■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 BSNDQ8WZ55 320 aa18.72■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
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HERC3-211ENST00000513325 FAM86C1Q9NVL1 165 aa18.72■□□□□ 0.59
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HERC3-211ENST00000513325 ADAM28Q9UKQ2 775 aa18.72■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa18.71■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 RFPL2O75678 378 aa18.71■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 FAM187BQ17R55 369 aa18.71■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 USP41Q3LFD5 358 aa18.71■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa18.71■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 PALB2Q86YC2 1186 aa18.71■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 TMEM105Q8N8V8 129 aa18.71■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
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HERC3-211ENST00000513325 USP20Q9Y2K6 914 aa18.71■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 C2orf16Q68DN1 1984 aa18.71■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 PLXNA3P51805 1871 aa18.71■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 ARHGEF35A5YM69 484 aa18.7■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 H0Y858 1186 aa18.7■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 TADA2AO75478 443 aa18.7■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 CYP11B2P19099 503 aa18.7■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
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HERC3-211ENST00000513325 TMEM132AQ24JP5 1023 aa18.7■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 TTC38Q5R3I4 469 aa18.7■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 GLYCTKQ8IVS8 523 aa18.7■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa18.7■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 PAAF1Q9BRP4 392 aa18.7■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 MFSD1Q9H3U5 465 aa18.7■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 PDZD7Q9H5P4 517 aa18.7■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 KCNK12Q9HB15 430 aa18.7■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP18.7■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 SNTG2Q9NY99 539 aa18.7■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 CASTOR2A6NHX0 329 aa18.69■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 N4BP3O15049 544 aa18.69■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 TGM5O43548 720 aa18.69■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 PRKCBP05771 671 aa18.69■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 RPL17P18621 184 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 LIG1P18858 919 aa18.69■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 NUBP1P53384 320 aa18.69■□□□□ 0.58
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