RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511439.5

TOPBP1-208, Transcript of DNA topoisomerase II binding protein 1, human

TSL 5

Gene TOPBP1, Length 1,142 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOPBP1-208	ENST00000511439	NAIP	Q13075	1403 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	LRRC37A3	O60309	1634 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	RASSF10	A6NK89	507 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	NEMP1	O14524	444 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	FKBP9	O95302	570 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	IL18BP	O95998	194 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	CYP17A1	P05093	508 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	CPE	P16870	476 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	SLC9A1	P19634	815 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	ETV4	P43268	484 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	LSS	P48449	732 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	EVA1C	P58658	441 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	IL2	P60568	153 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	OCRL	Q01968	901 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	EFHB	Q8N7U6	833 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	USP7	Q93009	1102 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	TTC1	Q99614	292 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	IFT22	Q9H7X7	185 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	CEP162	Q5TB80	1403 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	FOXP2	O15409	715 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	TGM5	O43548	720 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	BRINP1	O60477	761 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	RAD17	O75943	681 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	CR2	P20023	1033 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	AOAH	P28039	575 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	ID4	P47928	161 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	FNTB	P49356	437 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	SOX10	P56693	466 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	FOXE3	Q13461	319 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	DDB1	Q16531	1140 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	MIIP	Q5JXC2	388 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	ASB15	Q8WXK1	588 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	FAM89A	Q96GI7	184 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	MENT	Q9BUN1	341 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	EMC7	Q9NPA0	242 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	BTBD7	Q9P203	1132 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	MME	P08473	750 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	FUK	Q8N0W3	1084 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	C16orf92	Q96LL3	132 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	GBP4	Q96PP9	640 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	ASB1	Q9Y576	335 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	KIAA0232	Q92628	1395 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	EEA1	Q15075	1411 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	GPR39	O43194	453 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	CDC14B	O60729	498 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	MPIG6B	O95866	241 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	PTGS1	P23219	599 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	TGFB2	P61812	414 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	PHC1	P78364	1004 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	ABHD18	Q0P651	414 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	NFYC	Q13952	458 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	LRRC32	Q14392	662 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	STAT4	Q14765	748 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	EPHA7	Q15375	998 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	NRN1L	Q496H8	165 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	GPR158	Q5T848	1215 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	AGBL4	Q5VU57	503 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	C11orf74	Q86VG3	221 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOPBP1-208	ENST00000511439	PASD1	Q8IV76	773 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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