RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa2.65□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP2.65□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 CUTAO60888 179 aa2.65□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 ZBTB7AO95365 584 aa2.65□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 DHRS4L1P0CG22 281 aa2.65□□□□□ -1.99
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PDE4D-218ENST00000509368 XPAP23025 273 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
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PDE4D-218ENST00000509368 PDE6BP35913 854 aa2.65□□□□□ -1.99
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PDE4D-218ENST00000509368 ADCY2Q08462 1091 aa2.65□□□□□ -1.99
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PDE4D-218ENST00000509368 LLGL1Q15334 1064 aa2.65□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 ADRM1Q16186 407 aa2.65□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 CT83Q5H943 113 aa2.65□□□□□ -1.99
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PDE4D-218ENST00000509368 C4orf50Q6ZRC1 276 aa2.65□□□□□ -1.99
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PDE4D-218ENST00000509368 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 CYP2W1Q8TAV3 490 aa2.65□□□□□ -1.99
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PDE4D-218ENST00000509368 TSPEARQ8WU66 669 aa2.65□□□□□ -1.99
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PDE4D-218ENST00000509368 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 PLCD4Q9BRC7 762 aa2.65□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 ADI1Q9BV57 179 aa2.65□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 C22orf23Q9BZE7 217 aa2.65□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 KCTD10Q9H3F6 313 aa2.65□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 WDCPQ9H6R7 721 aa2.65□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 RXFP1Q9HBX9 757 aa2.65□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 WASH6PQ9NQA3 447 aa2.65□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 SAGE1Q9NXZ1 904 aa2.65□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 PRSS50Q9UI38 385 aa2.65□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 HDAC9Q9UKV0 1011 aa2.65□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 ASAP1Q9ULH1 1129 aa2.65□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 WDR7Q9Y4E6 1490 aa2.65□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa2.65□□□□□ -1.99
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PDE4D-218ENST00000509368 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa2.65□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa2.65□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 MYPNQ86TC9 1320 aa2.64□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 CCDC154A6NI56 674 aa2.64□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 FADS2P1A8MWK0 482 aa2.64□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 M0R3H8 397 aa2.64□□□□□ -1.99
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PDE4D-218ENST00000509368 PLA2G6O60733 806 aa2.64□□□□□ -1.99
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PDE4D-218ENST00000509368 EDNRBP24530 442 aa2.64□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 RPL10P27635 214 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 LTKP29376 864 aa2.64□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 STT3AP46977 705 aa2.64□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 DSC2Q02487 901 aa2.64□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 ZP2Q05996 745 aa2.64□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 NFATC3Q12968 1075 aa2.64□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 STARD3Q14849 445 aa2.64□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 RAB39AQ14964 217 aa2.64□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM132BQ14DG7 1078 aa2.64□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 CCDC38Q502W7 563 aa2.64□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 FKBP15Q5T1M5 1219 aa2.64□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 FYB2Q5VWT5 728 aa2.64□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 STEAP3Q658P3 488 aa2.64□□□□□ -1.99
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PDE4D-218ENST00000509368 CFAP161Q6P656 301 aa2.64□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 GALNT18Q6P9A2 607 aa2.64□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 CCDC62Q6P9F0 684 aa2.64□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 RINLQ6ZS11 566 aa2.64□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 WAPLQ7Z5K2 1190 aa2.64□□□□□ -1.99
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PDE4D-218ENST00000509368 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa2.64□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa2.64□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 LZTR1Q8N653 840 aa2.64□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 CDYL2Q8N8U2 506 aa2.64□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 FANCBQ8NB91 859 aa2.64□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa2.64□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa2.64□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 RMDN3Q96TC7 470 aa2.64□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 MANSC1Q9H8J5 431 aa2.64□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF287Q9HBT7 754 aa2.64□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 LMCD1Q9NZU5 365 aa2.64□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 SERPINB13Q9UIV8 391 aa2.64□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 ACSL6Q9UKU0 697 aa2.64□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa2.64□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa2.64□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 ABCA8O94911 1581 aa2.64□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 UACAQ9BZF9 1416 aa2.64□□□□□ -1.99
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