RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504849.5

RFC1-208, Transcript of replication factor C subunit 1, human

TSL 3

Gene RFC1, Length 873 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RFC1-208	ENST00000504849	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	ADO	Q96SZ5	270 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	RERE	Q9P2R6	1566 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	ARVCF	O00192	962 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	AKAP5	P24588	427 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	AK2	P54819	239 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	ADCY1	Q08828	1119 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	HS1BP3	Q53T59	392 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	USP53	Q70EK8	1073 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	NXPE1	Q8N323	547 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	LZTR1	Q8N653	840 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	CHST14	Q8NCH0	376 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	LUZP4	Q9P127	313 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	ABCC11	Q96J66	1382 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	ASXL2	Q76L83	1435 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	TRAF5	O00463	557 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	PMM2	O15305	246 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	B4GALT4	O60513	344 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	IL33	O95760	270 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	C1S	P09871	688 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	IFNGR1	P15260	489 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	ITGB6	P18564	788 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	SERPINB3	P29508	390 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	HAL	P42357	657 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	CASP2	P42575	452 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	ZNF445	P59923	1031 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	GPR85	P60893	370 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	AMPD2	Q01433	879 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	GALE	Q14376	348 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	TESK1	Q15569	626 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	ZNF627	Q7L945	461 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	EFHB	Q8N7U6	833 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	SLC5A5	Q92911	643 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	SCLT1	Q96NL6	688 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	GNRHR2	Q96P88	292 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	MKS1	Q9NXB0	559 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	ERVK-7	P63135	1459 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	MYOM1	P52179	1685 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	KLHL33	A6NCF5	533 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	EXOC5	O00471	708 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	TOM1	O60784	492 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	HRG	P04196	525 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	SETSIP	P0DME0	302 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	RHCE	P18577	417 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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